厦门霉素生物合成基因簇在吸水链霉菌FR008和白色链霉菌中的异源表达及其生物信息学分析

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本课题组前期从红树林来源的厦门链霉菌318菌株中分离得到一种苯并吡喃类化合物（厦门霉素），并对其生物学功能进行了研究，证实厦门霉素有抑制纤维化的多种生物效应，例如在体外抑制肺过度纤维化、通过抑制局部炎症来弱化肥胖性疤痕以及减弱机械应力的作用,因此它可能成为抗纤维化作用的潜在药物。
　　由于厦门霉素在其野生株中的产量较少，所以我们需要在合适的宿主内将厦门霉素进行异源表达。吸水链霉菌FR008发酵时间短，且遗传背景较清晰，已被证明具有适用于工业化生产的潜质，白色链霉菌可以产各种色素及抗生素，已被用于工业化生产的研究中，我们将厦门霉素基因簇导入到吸水链霉菌FR008及白色链霉菌中，并检测到厦门霉素在白色链霉菌及吸水链霉菌FR008中得到表达。
　　由于厦门链霉菌没有进行过培养基的筛选，本文对厦门链霉菌进行基础培养基的筛选，而介于在异源表达检测时发现异源表达菌株白色链霉菌-09404产厦门霉素的产量比较少，而异源表达菌株吸水链霉菌FR008-09404的产量较高，本文仅对吸水链霉菌FR008-09404进行了培养基优化的初步研究。结果厦门链霉菌在SFM培养基中产厦门霉素的产量最高，而吸水链霉菌FR008-09404在我们设计的1号培养基中产厦门霉素的量是厦门链霉菌在SFM培养基中产厦门霉素的2.5倍,黄豆粉、酵母膏、麦芽膏、葡萄糖、NaCl、K2HPO4、FeSO4·7H2O和MgSO4·7H2O可提高厦门霉素的产量，甘油、L-Asp和L-Tyr对厦门霉素产量的作用不大。
　　由于厦门霉素基因簇中的各个蛋白结构研究并不十分清楚，本文中以厦门霉素基因簇中的5个蛋白为研究对象,通过生物信息学技术，预测各蛋白的氨基酸组成、理化性质、二级结构、三级结构、跨膜区、亚细胞定位及蛋白指纹分析，为以后在蛋白质水平上研究厦门霉素的生物合成机制奠定基础。

著录项

作者
张金龙;
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作者单位

上海交通大学;

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授予单位上海交通大学;
学科生物学
授予学位硕士
导师姓名肖湘;
年度 2015
页码
总页数
原文格式 PDF
正文语种中文
中图分类基础理论;
关键词
吸水链霉菌; 白色链霉菌; 厦门霉素; 异源表达; 生物信息学分析; 抗纤维化作用; 生物合成;

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