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转录终止因子PDE191调控拟南芥rpoA基因的转录终止

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摘要

1 引言

1.1 光合作用与叶绿体

1.1.1 叶绿体的形态结构及作用机理

1.1.2 叶绿体的起源

1.2 叶绿体的发育

1.2.1 叶绿体基因组

1.2.2 叶绿体基因的表达调控

1.3 植物叶色突变

1.4 mTERF(线粒体转录终止因子)蛋白家族

1.4.1 mTERF蛋白家族的结构特征及分类

1.4.2 mTERF蛋白家族的功能

1.4.3 mTERF蛋白家族在动物中的研究进展

1.4.4 mTERF蛋白家族在光合器官中的研究进展

1.4.5 mTERF蛋白在拟南芥中的分子功能推测

2 材料与方法

2.1 实验材料

2.1.1 植物材料

2.1.2 主要仪器

2.1.3 菌株、质粒

2.1.4 抗生素

2.1.5 培养基配方

2.1.6 其它

2.2 实验方法

2.2.1 拟南芥培养条件及转化

2.2.2 T-DNA插入突变体的鉴定

2.2.3 热击感受态E.coli制备

2.2.4 大肠杆菌的转化

2.2.5 制备农杆菌感受态细胞

2.2.6 农杆菌的转化过程

2.2.7 克隆后载体的鉴定

2.2.8 碱裂解法小量抽取质粒DNA

2.2.9 小量酶切鉴定体系

2.2.10 连接片段或载体的体系

2.2.11 载体构建

2.2.12 DNA和RNA的抽取

2.2.13 RT-PCR和Real-Time PCR

2.2.14 亚细胞定位

2.2.15 透射电镜观察

2.2.16 免疫印迹杂交(Western Blot)

2.2.17 RNA印迹杂交(Northern Blot)

2.2.18 酵母双杂

2.2.19 蛋白表达纯化

2.2.20 EMSA

3 结果与讨论

3.1 PDE191基因突变导致拟南芥白化表型

3.2 PDE191编码三个转录本

3.3 PDE191基因编码一个mTERF蛋白定位至叶绿体中

3.4 pde191-1突变体中rpoA多顺反子的转录终止受到影响

3.5 pde191-1突变体中PEP调控的质体基因表达下调

3.6 PDE191结合在rpoA基因的3’末端序列

3.7 讨论

3.7.1 PDE191基因在拟南芥叶绿体发育中起重要作用

3.7.2 PDE191蛋白调控rpoA基因的正常转录终止

参考文献

致谢

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摘要

线粒体转录终止因子(mTERF)蛋白家族是一类多功能的蛋白家族,它包含4个亚家族,分别命名为mTERF1、mTERF2、mTERF3、mTERF4。这类蛋白在动物线粒体的基因复制、转录起始和终止等方面起着至关重要的作用。在本研究中,我们获得了一个由于T-DNA插入导致PDE191基因突变的拟南芥色素缺失突变体pde191-1,表型为白化及幼苗致死,叶绿体超微结构显示叶绿体发育不正常。PDE191蛋白具有7个32或33个氨基酸长度的mTERF基序重复序列,亚细胞定位检测到它定位于叶绿体中。通过Real time RT-PCR实验研究PDE191基因对叶绿体基因的转录终止作用,我们发现PDE191基因突变导致一系列的叶绿体基因无法正常终止转录,特别是rpoA基因,该基因与其下游基因的间隔区序列在突变体中的表达比野生型高20多倍。EMSA实验证实PDE191可在体外结合rpoA基因3'末端序列。Western blot分析表明,pde191-1突变体RpoA蛋白质的积累水平降低。同时,Real time RT-PCR实验表明叶绿体中PEP控制的质体基因表达普遍下调,绝大部分叶绿体其它基因的表达也不正常。我们推测PDE191通过作用于rpoA的正常转录终止从而调控PEP活性,进而影响叶绿体基因表达,并最终影响叶绿体发育。PDE191调控叶绿体基因转录终止的研究有助于我们对核基因调控叶绿体基因转录终止过程的深入了解。

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