拟南芥花药发育相关基因调控关系的预测

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1.前言

1.1生物信息学简介

1.2系统生物学简介

1.3基因表达与转录因子

1.4转录调控网络

1.5转录调控网络的研究现状

1.6本研究的目的意义和内容

2.材料与方法

2.1材料

2.1.1拟南芥花药基因芯片

2.1.2ATTED-Ⅱ数据库

2.1.3 MEME工具

2.1.4 STAMP工具

2.1.5 GO数据库

2.1.6 Perl语言

2.2实验方法

2.2.1花药表达基因的挑选

2.2.2共表达基因的筛选与分组

2.2.3基于共表达基因的Motif预测

2.2.4 Motif的数据库匹配

2.2.5转录调控关系的初步建立

2.2.6转录调控关系的筛选

2.2.7与已知调控关系的比对

2.2.8转录调控网络的绘制

3.结果与讨论

3.1本实验室研究背景

3.2预测到调控关系

3.3高可信度的调控关系

3.4被实验证实的调控关系

3.5花药发育调控网络

3.6讨论

致谢

参考文献

攻读学位期间取得的研究成果