论文说明
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摘要
1 文献综述
1.1 去势的定义和国内外研究
1.1.1 去势的定义和方法
1.1.2 去势的国内外研究现状
1.2 去势对主要组织器官的影响
1.2.1 去势对心脏的影响
1.2.2 去势对肝脏的影响
1.2.3 去势对脾的影响
1.2.4 去势对肺的影响
1.2.5 去势对肾的影响
1.2.6 去势对肌肉的影响
1.2.7 去势对脂肪的影响
1.3 昆明小鼠
1.4 转录组测序(RNA-seq)
1.4.1 RNA-seq定义
1.4.2 RNA-seq原理
1.4.3 RNA-seq技术平台
1.4.4 RNA-seq技术优势
1.4.5 RNA-seq技术的应用
2 研究的目的意义
3 材料与方法
3.1 实验主要仪器和试剂
3.1.1 主要仪器设备
3.1.2 主要试剂
3.2 主要试验方法
3.2.1 小鼠去势模型的构建及饲养
3.2.2 小鼠体重指标的测定
3.2.3 小鼠屠宰指标的测定和样品采集
3.2.4 石蜡切片的制作和HE染色
3.2.5 总RNA的提取
3.2.6 总RNA的质检
3.2.7 RNA-seq测序
3.2.8 数据分析
3.2.9 RNA-seq数据可靠性验证
3.2.10 基因与表型性状的相关性分析
4 结果和分析
4.1 去势模型的建立
4.2 早期去势对小鼠长期的表型影响
4.2.1 体重指标的影响
4.2.2 屠宰指标的影响
4.2.3 组织形态学的影响
4.3 不同处理间多组织转录组测序文库的构建
4.3.1 总RNA甲醛变性琼脂糖凝胶检测结果
4.3.2 总RNA毛细管电泳检测结果
4.3.3 cDNA文库目的片段检测结果
4.3.4 cDNA目的片段文库PCR扩增后的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
4.4 27个样品测序数据概述及数据质量评估
4.4.1 测序数据概述
4.4.2 测序数据质量评估
4.5 总体基因表达谱分析
4.6 假去势和双去势小鼠心、肝和骨骼肌转录组差异分析
4.7 假去势和双去势小鼠心、肝和骨骼肌差异转录本功能分析
4.7.1 早期极端去势对成年小鼠心脏形态学影响
4.7.2 早期极端去势对成年小鼠肝脏能量代谢的影响
4.7.3 早期极端去势对成年小鼠骨骼肌形态和迁移的影响
4.8 共表达基因模型与表型性状的相关性分析
5 讨论
5.1 小鼠为动物模型
5.2 去势模型的建立
5.3 早期去势对成年小鼠的表型影响
5.4 早期去势对成年小鼠不同组织转录组的总体影响
5.5 早期去势对成年小鼠不同组织转录组的差异影响
5.6 共表达基因模型与表型性状的关系
6 结论
参考文献
附录
致谢