桃EST-SSR引物开发及其在部分蔷薇科物种中的通用性研究

声明

摘要

缩略词

1 文献综述

前言

1．1 分子标记技术与SSR

1．2 SSR引物开发方法

1．2．1 实验挖掘法

1．2．2 软件挖掘法

1．3 研究进展

1．3．1 桃SSR引物开发现状

1．3．2 蔷薇科EST序列研究进展

1．4 本研究目的、意义及创新点

1．4．1 本研究目的

1．4．2 本研究意义

1．5 技术路线

2 材料与方法

2．1 材料、试剂与设备

2．2．1 实验材料

2．2．2 主要试剂

2．2．3 主要设备与耗材

2．2 实验方法

2．2．1 DNA准备

2．2．2 ESTs数据获得与处理

2．2．3 EST-SSR位点查找与引物设计

2．2．4 二核苷酸EST-SSR引物的PCR验证

2．2．5 EST-SSR引物在蔷薇科植物中的通用性检验

2．2．6 聚类分析

3 结果与分析

3．1 EST-SSRs规模

3．1．1 ESTs规模

3．1．2 EST-SSRs规模

3．2 EST-SSRs类型与分布频率

3．2．1 基序长度(Motif size)

3．2．2 基序组成(Motif forms)

3．2．3 重复次数(Repeat numbers)

3．3 EST-SSR引物

3．3．1 引物设计

3．3．2 引物抽选

3．4 引物验证

3．4．1 DNA质量检测

3．4．2 等位基因与杂合度

3．4．3 重复次数区间比较

3．5 桃EST-SSR引物在蔷薇科的通用性分析

3．5．1 通用性矩阵与缺失分布

3．5．2 等位基因与杂合度

3．5．3 聚类分析

4 讨论与结论

4．1 EST-SSR类型和分布频率

4．2 SSR引物开发效率和扩增

4．3 通用性分析

4．4 聚类分析

4．5 重要结论

5 展望

6 本研究创新点

参考文献

硕士阶段发表论文

致谢