鸡垂体特异性转录因子（Pit-1）多态性与屠宰性状的相关分析

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1前言

1.1 Pit-1(Pituitary specific transcription factor 1)基因的概述

1.1.1 Pit-1基因的发现

1.1.2 Pit-1蛋白结构及功能

1.1.3鸡Pit-1基因的结构

1.2不同物种间Pit-1基因序列的比较

1.3 Pit-1基因的表达部位及形式

1.4 Pit-1基因的作用机制

1.5 Pit-1蛋白在垂体前叶激素基因表达中的作用

1.6 Pit-1基因多态性研究现状

1.6.1 Pit-1基因多态性在人上的研究

1.6.2 Pit-1基因多态性在猪上的研究

1.6.3 Pit-1基因多态性在牛上的研究

1.6.4 Pit-1基因多态性在鸡上的研究

1.6.5 PCR-RFLP技术

1.7本研究的目的和意义

2材料和方法

2.1试验材料

2.1.1供试样本

2.1.2主要仪器设备

2.1.3主要试剂及配制

2.1.4引物及其信息

2.2试验方法

2.2.1技术路线

2.2.2基因组DNA提取(萨姆布鲁克，1995)

2.2.3 PCR反应及目的产物检测

2.2.4 PCR-RFLP内切酶种类和反应体系

2.2.5 PCR-RFLP酶切处理及基因型判定

2.3数据统计分析

2.3.1目标生产性状的测定与数据收集

2.3.2基因频率和基因型频率的计算

2.3.3 Hardy-Weinberg平衡状态的检验

2.3.4基因型与鸡的生产性能的相关分析

2.3.5核苷酸序列分析

2.3.6复合位点的遗传效应分析

3结果与分析

3.1模板DNA的抽提结果

3.2鸡Pit-1基因PCR扩增结果

3.2.1鸡Pit-1基因引物1的扩增结果

3.2.2鸡Pit-1基因引物2的扩增结果

3.2.3鸡Pit-1基因引物3的扩增结果

3.2.4鸡Pit-1基因引物4的扩增结果

3.2.5鸡Pit-1基因引物5的扩增结果

3.3酶切反应结果

3.3.1 PCR-RFLP-EcoT221酶切产物结果

3.3.2 PCR-RFLP-Fbal酶切产物结果

3.3.3 PCR-RFLP-EcoRV酶切产物结果

3.3.4 PCR-RFLP-EcoRⅠ酶切产物结果

3.3.5 PCR-RFLP-Hae Ⅲ酶切产物结果

3.3.6鸡Pit-1基因各多态位点测序结果

3.4鸡Pit-1基因遗传多态性的分析

3.4.1鸡Pit-1基因PER-RFLP-EcoT221酶切基因型在不同品种的频率分布

3.4.2鸡Pit-1基因PCR-RFLP-FbaI酶切基因型在不同品种的频率分布

3.4.3鸡Pit-1基因PCR-RFLP-EcoR Ⅰ酶切基因型在不同品种的频率分布

3.5鸡Pit-1基因多态性位点的遗传效应分析

3.5.1各品种鸡屠宰性状的分析比较

3.5.2鸡Pit-1基因酶切不同基因型对屠宰性状的遗传效应分析

3.6鸡Pit-1基因酶切各SNP位点对屠宰性状的遗传效应分析

3.6.1三个SNP位点单倍型组合及其频率

3.6.2三个SNP位点单倍型组合与屠宰性状相关性分析

4讨论

4.1试验材料的选择

4.2关于DNA抽提的优化

4.3关于PCR扩增反应

4.4关于鸡Pit-1基因的序列多态性分析

4.5鸡Pit-1基因各酶切基因型在不同品种的分布

4.6鸡Pit-1基因酶切多态性与屠宰性状的关系

5结论

参考文献

致谢