黄牛线粒体DNA D-环序列多态性与系统发育关系研究

Abstract

1前言

2文献综述

2.1分子系统学的发展及应用

2.2线粒体DNA

2.2.1哺乳动物线粒体DNA结构

2.2.2线粒体DNA的遗传特点

2.3 mtDNA多态性在牛种分子系统学中的应用

2.4中国黄牛的起源分化研究

2.5实验目的和意义

3材料与方法

3.1材料来源

3.1.1样品的采集

3.1.2主要仪器

3.1.3主要试剂

3.2实验方法

3.2.1全基因组DNA提取和检测

3.2.2线粒体DNA D-环全序列的扩增

3.2.3 PCR产物的回收纯化

3.2.4线粒体DNA D-loop全序列测定

4数据处理

4.1序列分析

4.2系统发育关系的建立

4.3系统发育树的准确性和统计性检验

5结果分析

5.1 mtDNA D-loop区全序列的PCR扩增、回收纯化和测序

5.2黄牛线粒体DNA D-环区序列多态性

5.2.1碱基组成

5.2.2序列的核苷酸多态性

5.3序列的中性检验和Mismatch分析

5.4黄牛线粒体DNA D-环单倍型分析

5.5中国黄牛不同地方种间群体遗传分析

5.6黄牛的系统发育关系研究

5.6.1实验材料

5.6.2重建黄牛的系统发育关系

5.6.3黄牛的系统发育关系

6分析与讨论

6.1线粒体DNA的母性遗传

6.2黄牛mtDNA D-环序列多态性

6.3黄牛品种间的遗传分化与基因流

6.4黄牛的起源和分类

6.5黄牛线粒体DNA D-环单倍型的分布特征

结论

参考文献

致谢