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基于分子生物技术对自然及人工系统中微生物种群的分析研究

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摘要

微生物分子生态学是在微生物生态学的基础上,将现代分子生物技术作为辅助工具,克服原始微生物学及生态学中依赖于纯培养及表型观察的弊端,使得研究更加深入,研究结果更加全面精准。微生物分子生态学已经被广泛应用于环境生态治理、医学健康、工业生产等很多领域。
  应用于微生物分子生态学研究的现代分子生物技术有很多,包括16S rDNA克隆文库法、PCR-DGGE技术、T-RFLP技术、荧光原位杂交技术、实时荧光定量PCR、Biolog技术、二代测序及元基因组技术等。这些技术大都是基于微生物DNA序列信息,在PCR的基础上再进行测序,最后利用数据库分析序列信息,从而探究微生物群落机构及代谢特性。
  本研究的目的就是结合几种现代生物学技术,选取自然及人工生态系统作为研究对象进行微生物菌群结构分析。自然生态系统选择的是与人类密切相关的肠道微生态,通过16S rDNA克隆文库法及PCR-DGGE技术,对肠道菌群失衡小鼠及经桑叶多糖组分治疗的小鼠的肠道菌群进行分析,结果证明桑叶活性多糖对小鼠肠道菌群有调节作用,可以用于一些慢性病的防治;人工生态系统选择的是四个具有相同污水处理工艺(A2O,anaerobic anoxic oxic)的污水处理厂的活性污泥,通过16S rDNA克隆文库法、PCR-DGGE技术及T-RFLP技术研究微生物菌群结构,利用Biolog技术对其碳源利用情况进行探讨,从而进一步分析菌群结构与功能之间的关系,发现四个工艺虽然多样性有些许差异,但是主要的优势菌都是Proteobacteria,证明菌群优势菌主导活性污泥的处理性能。

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