首先,从雨生红球藻中克隆了β-胡萝'/> 酿酒酵母中虾青素生物合成及其代谢调控的研究-博士-中文学位【掌桥科研】
首页> 中文学位 >酿酒酵母中虾青素生物合成及其代谢调控的研究
【6h】

酿酒酵母中虾青素生物合成及其代谢调控的研究

代理获取

目录

声明

致谢

摘要

缩写词表

1 文献综述

1.1 虾青素的概述

1.1.1 虾青素的简介

1.1.2 虾青素的理化性质

1.1.3 虾青紊的生理功能与应用

1.2 虾青素的生产方法与现状

1.2.1 化学合成

1.2.2 生物提取

1.3 虾青素的生物合成途径

1.4 虾青素的异源合成研究进展

1.4.1 利用细菌异源合成虾青素的研究进展

1.4.2 利用酵母异源合成虾青素的研究进展

1.5 代谢改造酿酒酵母生产萜类化合物的研究

1.5.1 酿酒酵母生产的代表性萜类化合物

1.5.2 酿酒酵母中生产萜类化合物的代谢途径工程研究

1.6 合成生物学研究中常用的代谢调控策略

1.7 本课题研究的内容与意义

2 虾青素生物合成途径基因的克隆与表达

2.1 引言

2.2 实验设备与材料

2.2.1 仪器设备

2.2.2 试剂和引物

2.2.3 菌株和质粒

2.2.4 主要溶液及培养基配置

2.3 实验方法

2.3.1 雨生红球藻RNA的抽提与基因的反转录

2.3.2 分子克隆实验

2.3.3 酿酒酵母转化方法

2.3.4 酿酒酵母的整合基因型验证

2.3.5 pUMRI质粒的整合与选择标记的去除

2.3.6 酿酒酵母的摇瓶培养

2.3.7 定性和定量分析荧光强度

2.3.8 类胡萝卜素的抽提与检测分析

2.4 实验结果与讨论

2.4.2 crtZ和bkt基因的克隆

2.4.3 整合crtZ和bkt基因合成虾青素

2.4.4 crtZ和bkt的密码子优化

2.4.5 虾青素构型的测定

2.4.6 CrtZ和BKT的底物选择性分析

2.4.7 OcrtZ和Obkt基因拷贝数对虾青素产量的影响

2.5 本章小结

3 结合定向进化与代谢工程调控限速酶提高虾青素产量

3.1 前言

3.2 实验材料与试剂

3.3 实验方法

3.3.1 重组质粒的构建

3.3.2 OBKTM的定向进化流程

3.3.3 融合蛋白的构建

3.3.4 OBKTM和OCrtZ的共定向进化

3.3.5 重组菌株的构建流程

3.3.6 菌株的稳定性分析

3.3.7 菌株的培养和类胡萝卜素产物分析

3.3.8 角黄素标曲的测定

3.4 实验结果与讨论

3.4.1 Fe2+辅因子对虾青素合成的影响

3.4.2 表达CrtE03M对前体物质β-胡萝卜素产量的影响

3.4.3 OBKT的定向进化

3.4.4 CrtE03M和OBKTM对虾青素产量的影响

3.4.5 YastD-03双倍体菌株产虾青素的稳定性分析

3.4.6 OCrtZ和OBKTM融合表达

3.4.7 OCrtZ和OBKTM共定向进化

3.5 本章小结

4 酿酒酵母温度响应蛋白开关的设计与构建

4.1 前言

4.2 实验材料与试剂

4.2.1 试剂和引物

4.2.2 菌株

4.3 实验方法

4.3.1 基因的扩增与质粒的构建

4.3.2 GAL4基因的敲除

4.3.3 温敏型Gal4的定向进化

4.3.4 荧光显微镜和流式细胞仪分析EGFP的强度

4.3.5 实时荧光定量PCR

4.3.6 培养基中葡萄糖浓度的测定

4.3.7 乙醇标曲的制作与发酵液中乙醇含量的测定

4.3.8 番茄红素的抽提与分析

4.3.9 分批补料发酵

4.4 实验结果

4.4.1 温度响应的动态调控系统设计

4.4.2 温敏型Gal4定向进化商通量筛选方法的建立

4.4.3 温敏型Gal4突变体的筛选和鉴定

4.4.4 温度对温敏型Gal4调控系统的影响

4.4.5 Gal4温敏型调控系统的表征

4.4.6 温度调控系统在番茄红素合成中的应用

4.4.7 利用温度调控系统进行番茄红素的两阶段发酵生产

4.5 本章小结

5 温度响应型虾青素生物合成途径的构建

5.1 引言

5.2 材料和试剂

5.3 实验方法

5.3.1 表达载体的构建

5.3.2 菌株的构建

5.3.3 产虾青素菌株的摇瓶培养

5.4.1 温度调控的虾青素合成菌株的构建与表征

5.4.2 虾青素的高密度发酵生产

5.5 本章小结

6 结论与展望

6.1 结论

6.2 展望

参考文献

附录

作者简历及攻读博士学位期间的研究成果

展开▼

摘要

虾青素是自然界中一种具有较强抗氧化能力的类胡萝卜素,其中的3S-3'S构型生物学活性最高,在医药品、食品、饲料以及化妆品等生产领域具有广泛的应用价值。为了提高虾青素的生产效率,降低生产成本,本文以酿酒酵母为操作平台,以蛋白质分子改造和动态代谢调控为手段,开展一系列合成生物学方面的应用基础研究,构建产虾青素的酿酒酵母细胞工厂,实现虾青素的高效生物合成。
  首先,从雨生红球藻中克隆了β-胡萝卜素酮化酶和β-胡萝卜素羟化酶基因,并通过密码子优化提高了其表达量。将这两个基因整合到产β-胡萝卜素酿酒酵母工程菌中,成功合成了3S-3'S构型的虾青素。在明确这两个酶的底物选择性后,进一步对这两个酶进行了拷贝数的精细调控,最终通过整合各两个或三个拷贝的OBKT和OCrtZ,获得YPP9和YPP13菌株,虾青素含量分别达到3.54 mg/g DCW和4.20 mg/g DCW。
  为了进一步提高虾青素产量,代谢前体物的充足供应和高效转化是必要条件。为此,首先用红发夫酵母牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸(GGPP)合酶的阳性突变体CrtE03M替换出发菌株YPP0中的野生型CrtE,构建的Ycarot-02菌株中前体物质β-胡萝卜素的产量提高56%,达到了16.37 mg/g DCW。其次,通过类胡萝卜素之间的颜色差异,建立了OBKT的定向进化策略,获得了一株OBKTM阳性突变体,促进了β-胡萝卜素向下游产物的转化,与表达野生型OBKT的对照菌株相比,β-胡萝卜素的转化率提高了50%,同时角黄素的产量提高了1.4倍。结合OBKTM、CrtE03M和途径中其它关键酶基因的过表达,以及辅因子Fe2+的添加,使构建的双倍体菌株YastD-03的虾青素含量达到8.10 mg/g DCW(47.18mg/L)。在此过程中发现,OCrtZ的酶活也是制约虾青素产量的一个关键因素,因此进一步对OCrtZ和OBKTM进行了共定向进化,获得了OCrtZM1和OBKTM29突变体,在Ycarot-02菌株中同时表达这两个阳性突变体后,构建的YPP-27菌株虾青素含量达到了5.70 mg/g DCW,相比于OCrtZ和ObktM组合表达时提高了38.7%。虽然YPP-27产量低于之前构建的双倍体YastD-03,但由于代谢压力相对较小,菌株的遗传稳定性更好。
  在对构建的产虾青素酿酒酵母菌株进行发酵研究的过程中,发现类胡萝卜素过早积累会对细胞生长造成不利影响,最终影响高密度发酵。为了解决人工合成途径和底盘细胞之间的相互干扰,在接下来的研究中基于GAL调控系统,开发了一套温度响应的动态调控系统,使细胞生长和产物积累分成两个阶段进行。在敲除GAL80基因的基础上,GAL启动子的活性只受转录激活因子Gal4的控制。基于以上原理,首先利用番茄红素作为指示来建立高通量筛选方法,筛选出了一株温度敏感并且在目标温度保留较高调控活性的突变体Ga14M9,通过温度优化发现在24℃时,Gal4M9的活性最佳。然后,利用报告基因EGFP的表达情况以及番茄红素合成途径中基因的转录水平,对基于Gal4M9构建的温敏型调控系统进行了表征,确认了其温度响应特性。随后,利用番茄红素作为试验产品,构建了温度调控的Ylyc-TS03(+)菌株,在高密度发酵实验中,成功实现了细胞生长和产物合成阶段的分离,并且番茄红素产量达到了1.14 g/L。最后,将该温敏调控系统进一步应用到了虾青素的生物合成中,构建了温敏型菌株Yast-TS9,在摇瓶发酵中表现出明显的温度响应,温度从30℃切换至24℃后虾青素产量提高了28倍,含量为4 mg/g DCW。在补料发酵中,OD600达到了250左右,实现了高密度发酵,类胡萝卜素的积累也呈现了严谨的温度调控模式,最后总类胡萝卜产量达到505 mg/L。
  本研究结合基因挖掘、表达优化、蛋白质工程、动态代谢调控等手段,成功构建了产虾青素酿酒酵母工程菌株。这项工作有效地将理论研究和应用研究进行结合,将为虾青素的生物合成提供技术支持,同时研究过程中开发的蛋白质改造和代谢调控策略将为利用酿酒酵母合成其他高附加值化合物提供方法借鉴。

著录项

  • 作者

    周萍萍;

  • 作者单位

    浙江大学;

  • 授予单位 浙江大学;
  • 学科 化学工程与技术
  • 授予学位 博士
  • 导师姓名 叶丽丹;
  • 年度 2018
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类 TS261.11;
  • 关键词

    酿酒酵母; 虾青素; 生物合成; 代谢调控;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号