基于线粒体基因组的膜翅目茧蜂科(Hymenoptera：Braconidae)比较基因组学与系统发育研究

声明

论文说明

致谢

摘要

缩写与术语表

第一章 文献综述

1．1 线粒体基因组学

1．1．1 线粒体起源

1．1．2 线粒体基因组学

1．2 线粒体基因组基本特征

1．2．1 线粒体基因组形态特征

1．2．2 线粒体基因组进化

1．2．3 线粒体基因组的分子标记

1．3 线粒体基因组在昆虫系统发育研究中的应用

1．3．1 昆虫线粒体基因组测序进展

1．3．2 昆虫线粒体基因组结构

1．3．3 昆虫线粒体基因组重排及机理

1．4 基于线粒体基因组的昆虫系统发育研究

1．4．1 系统发育研究方法

1．4．2 基于线粒体基因组的昆虫系统发育研究

1．5 茧蜂科系统发育研究

1．5．1 茧蜂科分类地位

1．5．2 茧蜂科分类背景

第二章 基本材料与方法

2．1 技术路线

2．2 标本的收集

2．3 主要仪器与试剂

2．3．1 主要试剂

2．3．2 主要仪器

2．4 试验和分析方法

2．4．1 线粒体基因组测序

2．4．2 线粒体基因组注释

2．4．3 比较基因组学分析

2．4．4 系统发育分析

2．4．5 分化时间推断

第三章 茧蜂科线粒体基因组基本特征

3．1 齿腹茧蜂Acanthormius sp．线粒体基因组基本特征

3．2 灰毛非卡茧蜂Afrocampsis griseosetosus线粒体基因组特征

3．3 头高腹茧蜂Capitonius sp．线粒体基因组特征

3．4 纵卷叶螟黑折脉茧蜂Cardiochiles fuscipennis线粒体基因组特征

3．5 扁体茧蜂Elasmosoma sp．线粒体基因组特征

3．6 额突茧蜂Eumacrocentrus sp．线粒体基因组特征

3．7 短管马尾茧蜂Euurobracon breviterebrae线粒体基因组特征

3．8 厚腿茧蜂Histeromerus sp．线粒体基因组特征

3．9 滑茧蜂Homolobus sp．线粒体基因组特征

3．10 探茧蜂Ichneutes sp．线粒体基因组特征

3．11 稀脉茧蜂Paroligoneurus sp．线粒体基因组特征

3．12 前眼茧蜂Proterops sp．线粒体基因组特征

3．13 奇脉茧蜂Mirax sp．线粒体基因组特征

3．14 角腰茧蜂Pambolus sp．线粒体基因组特征

3．15 光鞘反颚茧蜂Phaenocarpa sp．线粒体基因组特征

3．16 缺凹茧蜂Pselaphanus sp．线粒体基因组特征

3．17 拟塬腹茧蜂Pseudognaptodon sp．线粒体基因组特征

3．18 三缝茧蜂Triraphis sp．线粒体基因组特征

3．19 二色屏腹茧蜂Sigalphus bicolor线粒体基因组特征

3．20 丽下腔茧蜂Therophlius festivus线粒体基因组特征

3．21 刀腹茧蜂Xiphozele sp．线粒体基因组特征

3．22 颈双缘姬蜂Diadromus collaris线粒体基因组特征

第四章 茧蜂科昆虫线粒体基因组比较分析

4．1 茧蜂科昆虫线粒体基因组的重排

4．2 茧蜂科昆虫碱基组成分析

4．3 起始密码子与终止密码子的使用

4．4 茧蜂科昆虫线粒体基因组基因间隔区与重叠区

4．5 茧蜂科线粒体基因组进化速率

第五章 基于线粒体基因组的茧蜂科系统发育及时间分化分析

5．1 茧蜂科系统发育分析

5．1．1 基于DNA序列构建系统发育树

5．1．2 基于氨基酸序列的系统发育分析

5．1．3 蚜茧蜂亚科分类地位

5．2 茧蜂科昆虫进化时间及寄生习性进化分析

第六章 总结与讨论

6．1 结果与讨论

6．1．1 茧蜂科昆虫线粒体基因组测序、注释及特征研究

6．1．2 茧蜂科线粒体基因组的比较基因组学

6．1．3 基于线粒体基因组的茧蜂科进化分析

6．2 创新之处

6．3 不足之处

6．4 今后的研究方向

参考文献

附录Ⅰ 作者简历及发表的论文