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猪圆环病毒2型编码蛋白4的鉴定及其感染后的宿主免疫器官基因表达谱分析

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论文说明

摘要

论文创新点

研究意义

技术路线

第一部分 文献综述

第一章 猪圆环病毒2型研究进展

1.PCV病毒的发现与分类

2.基因组结构及其编码蛋白

3.PCV复制

4.PCV转录

5.病毒内吞

6.PCV2编码蛋白与宿主的相互作用

7.PCV2对免疫系统的影响

第二章 芯片技术及应用进展

1.基因芯片

2.蛋白质芯片

第二部分 研究内容

第一章 ORF4编码产物蛋白水平及转录水平的鉴定

1.材料与方法

2.结果

3.讨论

第二章 PCV2 ORF4缺失体构建与ORF4蛋白功能分析

1.材料与方法

2.结果

3.讨论

第三章 猪圆环病毒2感染后的宿主免疫器官的基因表达谱分析

1.材料与方法

2.结果

3.讨论

全文总结

参考文献

附录A 常用缓冲液及配方

附录B 攻博期间发表或待发表的学术论文

致谢

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摘要

猪圆环病毒2型(porcine circovirus type2,PCV2)是仔猪多系统衰竭综合症(Postweaning multisystemic wasting syndrome,PMWS)的主要病原。目前的研究已经鉴定了该病毒的三个编码蛋白,即ORF1编码的与复制相关的Rep蛋白,ORF2编码的衣壳蛋白Cap,以及ORF3编码的凋亡相关蛋白ORF3蛋白。本研究鉴定了猪圆环病毒2型ORF4编码蛋白,并分析了猪圆环病毒2感染后宿主免疫器官的基因表达谱,旨在探讨PCV2编码蛋白在致病中的作用及其宿主的反应性。
   1.PCV2ORF4蛋白转录与蛋白水平的验证
   本研究利用表位预测软件BepiPred1.0 Server分析出的PCV2潜在的ORF4抗原表位,借助化学合成法合成了含PCV2-ORF4的表位多肽,以合成的表位多肽和真核表达质粒pCI-ORF4为抗原免疫BALB/c小鼠制备了抗PCV2-ORF4编码蛋白的单克隆抗体和多克隆抗体。利用制备的ORF4单克隆抗体和和多克隆抗体可在PCV2感染及ORF4基因转染的PK15细胞中检测到特异性的信号,但不能在正常PK15细胞和ORF1、2、3基因转染的细胞检测到任何信号,说明在PCV2感染细胞中独立于ORF1、ORF2和ORF3外存在基因编码的新的病毒蛋白ORF4。Northern blot的结果显示,ORF4相应的转录本约为180bp,利用了与ORF3不同的起始密码子,其转录本完全叠加在ORF3内,转录方向与ORF3相同。上述结果分别从蛋白和转录本水平验证了PCV2ORF4基因的转录和表达,为后续该蛋白的功能研究提供了依据。
   2.ORF4蛋白体内外功能研究
   为了分析PCV2-ORF4编码蛋白的功能,本研究构建了缺失ORF4蛋白的感染性克隆(PCV2△),并以PK15细胞为载体拯救出缺失体病毒PCV2△,经复制动力学分析提示ORF4蛋白是PCV2复制的非必需蛋白。利用拯救的PCV2△和野生型病毒(wPCV2)分别感染细胞和小鼠分析ORF4蛋白的功能。结果显示,PCV2△感染细胞后能够引起caspase-3、8、9活性的提高,提示ORF4与凋亡抑制相关。在PCV2△感染小鼠体内,与野生型病毒比较,PCV2△感染鼠的血清病毒载量提高约20~100倍,并展示早期较为严重的淋巴组织损伤。与此同时在PCV2△体内出现了严重的CD3+CD4+、CD3+CD8+、CD4+CD8+T淋巴细胞减少,说明ORF4蛋白缺失的PCV2在小鼠体内比野生型PCV2具有更强的致病力,揭示ORF4基因是PCV2致病的负调控基因。
   3.猪圆环病毒2感染后的宿主免疫组织基因表达谱分析
   为了分析PCV2感染后免疫器官的反应性,我们使用基因芯片技术在转录组学水平分析了PCV2感染猪淋巴结和小鼠脾脏的基因表达谱。结果显示,在PCV2感染猪的腹股沟淋巴结中发现66个差异转录本,主要包括:44个涉及大分子代谢(20%)、分化及发育(18%)、转运(13%)及细胞骨架(7%)相关上调转录本,22个涉及免疫及炎症反应(57%)、代谢(9%)的下调转录本。在PCV2感染的小鼠脾脏发现137个差异转录本,包括:40个影响代谢(12%)、分化及发育(12%)、免疫(10%)、信号转导(10%)、大分子生物合成相关(10%)的上调转录本,73个影响代谢(13%)、分化及发育(15%)、免疫反应(12%)、大分子生物合成(11%)及信号转导相关(11%)的下调转录本。应用荧光定量PCR方法对基因芯片所获得的20个猪差异转录本和29个小鼠差异转录本信息进行了验证,结果显示,除小鼠的下调转录本的变化趋势差异较大外,其他转录本的芯片结果与荧光定量PCR的结果基本完全相符。western-blot分析显示,解聚因子cofilinl和DSTN的非磷酸化活性形式的蛋白水平在感染后发生了上调,与芯片中的转录本水平变化一致,提示PCV2的感染可能通过解聚因子的上调诱导宿主发生肌动蛋白解聚。

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