罗布泊嗜（耐）盐放线菌的物种多样性、抗生素合成基因以及盐胁迫响应机理初探

声明

摘要

第一章 文献综述

1．1 嗜盐放线菌概述

1．2 嗜(耐)盐放线菌概述

1．2．1 嗜(耐)盐放线菌定义

1．2．2 嗜盐放线菌的生理学研究

1．2．3 嗜盐放线菌的应用价值

1．3 嗜(耐)盐放线菌物种多样性的研究

1．3．1 嗜(耐)盐放线菌生物多样性的研究方法

1．3．2 嗜(耐)盐放线菌的多相分类研究进展

1．3．3 嗜(耐)盐放线菌生物多样性的研究现状

1．4 嗜(耐)盐放线菌生物活性多样性

1．4．1 嗜(耐)盐放线菌生物活性研究现状

1．4．2 嗜(耐)盐放线菌生物活性物质研究现状

1．5 嗜(耐)盐放线菌抗生素功能基因研究概况

1．6 嗜(耐)盐放线菌嗜盐机制的研究现状

1．7 新疆罗布泊嗜(耐)盐放线菌资源概况

1．7．1 罗布泊地区简介

1．7．2 罗布泊地区嗜盐放线菌研究现状

1．8 研究目的和研究意义

1．9 技术路线

第二章 罗布泊及其周边盐碱土可培养嗜(耐)盐放线菌物种多样性分析

2．1 实验材料

2．1．1 供试土样

2．1．2 分离培养基

2．1．3 主要实验仪器及试剂

2．2 实验方法

2．2．1 菌株的分离与纯化

2．2．2 16S rRNA基因PCR扩增和系统进化分析

2．2．3 放线菌NaCl耐受范围测定

2．3 结果与分析

2．3．1 罗布泊可培养嗜(耐)盐放线菌物种多样性

2．3．2 罗布泊周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌物种多样性

2．3．3 罗布泊与周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌物种多样性的比较

2．4 讨论

第三章 潜在新物种的多相分类研究

3．1 实验材料

3．1．1 供试菌株

3．1．2 主要实验仪器及试剂

3．2 实验方法

3．2．1 放线菌基因组DNA的提取

3．2．2 放线菌16S rDNA基因的PCR扩增

3．2．3 生理生化特征

3．2．4 形态特征描述

3．2．5 细胞化学组分分析

3．2．6 系统发育分析

3．3 结果与分析

3．3．1 糖多孢菌属(Saccharopolyspora)新物种TRM 45123多相分类鉴定

3．3．2 糖霉菌属(Glycomyces)新物种TRM 45387、TRM 45198和TRM 45127多相分类

3．3．3 盐多孢菌属(Halopolyspora)新物种TRM 45668和TRM 45658多相分类

3．4 讨论

第四章 罗布泊及周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌抗生素合成基因多样性分析

4．1 实验材料

4．1．1 供试菌株

4．1．2 主要实验仪器及试剂

4．2 实验方法

4．2．1 基因组DNA的提取

4．2．2 抗生素基因的PCR扩增

4．2．3 PCR产物回收

4．2．4 放线菌中抗生素合成基因的克隆

4．3 结果与分析

4．3．1 罗布泊及其周边盐碱环境土壤嗜(耐)盐放线菌抗生素合成基因分布

4．3．2 罗布泊及其周边盐碱环境嗜(耐)盐放线菌抗生素合成基因多样性

4．4 讨论

第五章 罗布泊及其周边盐碱土嗜(耐)盐放线菌活性菌株的筛选及评价

5．1 实验材料

5．1．1 供试菌株

5．1．2 培养基

5．1．3 抗菌筛选指示菌

5．1．4 主要实验仪器及试剂

5．2 实验方法

5．2．1 抗菌活性菌株初筛

5．2．2 抗菌活性菌株复筛

5．3 结果与分析

5．3．1 抗菌活性菌株初筛

5．3．2 抗菌活性菌株的复筛

5．4 讨论

第六章 6株活性放线菌次级代谢产物的分离与鉴定

6．1 实验材料

6．1．1 菌株信息

6．1．2 培养基

6．1．3 主要实验仪器及试剂

6．2 实验方法

6．2．1 接种及发酵

6．2．2 发酵产物初步分离

6．2．3 发酵产物的柱层析分离

6．2．4 发酵液提取物中化合物的进一步分离纯化

6．2．5 各菌株次级代谢产物分离流程图

6．2．6 单体化合物的结构鉴定

6．3 结果与分析

6．3．1 次级代谢产物的分离

6．3．2 化合物结构鉴定

6．4 讨论

第七章 嗜盐放线菌TRM 45611嗜盐机制的研究

7．1 实验材料

7．1．1 实验菌株

7．1．2 主要实验仪器

7．2 实验方法

7．1．1 菌株TRM 45611培养及样品的制备

7．1．2 菌株TRM 45611转录组测序及分析

7．3 结果与分析

7．3．1 菌株TRM 45611生长曲线及耐盐性测定结果

7．3．2 菌株TRM 45611转录组测序概况

7．4 讨论

总结与展望

本研究工作总结

展望

参考文献

附录

攻读博士学位期间发表的论文

致谢