利用Faecalibacterium菌16S rDNA基因标记检测环境水体中鸭粪便污染的研究

1 绪 论

1.1 畜禽粪便污染

1.2 鸭粪便污染

1.2.1 鸭粪便对空气的污染

1.2.2 鸭粪便对土壤的污染

1.2.3 鸭粪便对环境水的污染

1.3 粪便污染特点

1.4 鸭粪便污染的解决途径

1.5 水体中粪便污染源的检测方法

1.5.1 MST的指示物选择

1.5.2 MST的源指示物检测技术

1.5.3 MST的源解析方法

1.6 检测水体粪便污染的新型指示菌

1.7 粪便指示菌在水体中的稳定性研究

1.8 研究目的与意义

1.9 技术路线

1.10 研究创新点

2 实验材料和方法

2.1 实验材料

2.1.1 粪便样品的采集

2.1.2 环境水样采集

2.1.3 实验试剂与耗材

2.1.4 实验试剂盒

2.1.5 主要仪器设备

2.1.6 实验主要溶液及配制方法

2.2.1 粪便样品基因组DNA提取

2.2.2 粪便基因组DNA的验证

2.2.3 高通量测序

2.2.4 基因标记物设计

2.2.5 不同鸭粪便样品间的微生物多样性分析

2.2.6 基因标记物特异性验证

2.2.7 测定基因标记物阳性率

2.2.8 确定基因标记物灵敏度

2.2.9 确定最佳鸭粪便Faecalibacterium菌特异性引物

2.2.10 基因标记物稳定性的初步探究

2.2.11 环境水样验证

3 实验结果与讨论

3.1 基因组DNA提取结果

3.1.1 基因组DNA结果分析

3.2 微生物多样性

3.2.1 高通量测序结果

3.2.2 不同物种粪便微生物多样性

3.2.3 不同物种粪便微生物多样性分析

3.2.4 不同鸭粪便样品的微生物多样性

3.2.5 不同鸭粪便样品的微生物多样性分析

3.2.6 Faecalibacterium菌在各物种中的占比

3.3.1 特异性结果

3.3.2 特异性结果分析

3.3.3 阳性率结果

3.3.4 阳性率结果分析

3.4.1 重组质粒的测序检测

3.4.2 连接转化实验讨论

3.4.3 灵敏度结果

3.4.4 灵敏度结果分析

3.4.5 确定最佳鸭粪便基因标记物

3.5 基因标记物稳定性探究结果

3.5.1 水环境和温度对基因标记物稳定性的影响

3.5.2 光照时间对基因标记物稳定性的影响

3.5.3 基因标记物稳定性探究结果分析

3.6.1 环境水样检测结果

3.6.2 环境水样检测结果分析

4 结论与展望

4.1 总结

4.2 讨论

4.3 后续探究工作展望

参考文献

附录

A. 作者在攻读学位期间发表的论文目录

B. 学位论文数据集

致谢