基于拉氏图重要性采样的蛋白质结构预测方法

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目 录

第一章绪 论

1.1 研究背景和意义

1.2 国内外发展以及研究现状

1.3 论文的主要内容

1.4 论文组织架构

第二章理论基础以及蛋白质结构预测关键技术

2.1 蛋白质结构

2.2 蛋白质结构预测

2.3 差分进化算法

2.4 蛋白质结构预测的关键技术

2.4.1 片段组装

2.4.2 二级结构

2.4.4 Rosetta

2.5预测精度的性能指标

1) 均方根偏差

2) TM-score

2.6 本章小结

第三章基于二级结构片段组装的群体蛋白质结构预测方法

3.1 问题描述

3.2 算法描述

3.3 实验结果与分析

3.3.1 材料以及实验设定

3.3.2 实验结果与分析

3.4 本章小结

第四章 Loop区域重要性采样的蛋白质结构预测方法

4.1 基于拉氏图的重要性采样方法

4.1.1 基于拉氏图的采样

4.1.2 基于Loop区域的重采样方法

4.2 随机排序选择策略

4.3 RSDE 算法描述

4.4 实验结果及分析

4.4.1 材料以及实验设定

4.4.2 实验结果

4.4.3 二级结构预测精度分析

4.4.4 收敛性及近天然态采样能力分析

4.4.5 聚类结果分析

4.4.6 基于Loop区域的重要性采样分析

4.4.7 与其他方法进行比较

4.4.8 CASP12实验分析

4.5 本章小结

第五章总结与展望

5.1 总结

5.2 展望

参考文献

致 谢

作者简介

1 作者简历

2 攻读工学硕士学位期间发表的学术论文

3 参与的科研项目及获奖情况

4 发明专利

5 软件著作权

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