抗小袋虫药物的筛选及替硝唑抗小袋虫的转录组分析

声明

符号表

第1章 文献综述

1.1 结肠小袋纤毛虫

1.1.1 生活史

1.1.2 流行病学

1.1.3 致病机制

1.1.4 临床症状

1.1.5 诊断

1.2 小袋虫病防治药物的研究进展

1.2.1 硝基咪唑类（Nitromidazole）

1.2.2 抗小袋纤毛虫药物筛选实验用药

1.3 转录组技术在揭示药物作用机理方面应用研究

1.3.1 RNA-seq技术

1.3.2 转录组在药物作用机理方面的研究进展

1.4 本研究的目的和意义

第2章 巴马香猪源和豚鼠源结肠小袋纤毛虫感染情况调查及分子鉴定

2.1 材料

2.1.1 样品

2.1.2 仪器设备及试剂

2.1.3 使用溶液及配制

2.2 方法

2.2.1 粪便直接涂片镜检

2.2.2 样品DNA提取

2.2.3 引物设计与合成

2.2.4 PCR扩增

2.2.5 凝胶电泳

2.2.6 序列比对与种系进化分析

2.3 结果

2.3.1 镜检及感染情况结果

2.3.2 18SrRNA基因PCR扩增结果

2.3.3 ITS1-5.8SrRNA-ITS2基因PCR扩增结果

2.3.4 遗传多态性结果

2.4 讨论

第3章 抗结肠小袋纤毛虫药物的筛选

3.1 材料

3.1.1 药物与虫株

3.1.2 主要试剂及药物配制

3.1.3 主要仪器

3.2 实验方法

3.2.1 小袋虫滋养体体外扩增培养

3.2.2 小袋虫滋养体抑杀药物的筛选

3.2.3 不同梯度浓度药物的急性毒性试验

3.2.4 药物抑杀小袋虫相对死亡率的计算

3.2.5 LC50及其95%置信限的计算

3.3 结果

3.3.1 10种药物对小袋虫滋养体的抑杀效果

3.3.2 有效药物的半数致死浓度和最小杀虫浓度

3.4 讨论

第4章 替硝?抗小袋虫的转录组分析

4.1 材料

4.1.1 样品采集及培养

4.1.2 试剂耗材及仪器

4.2 方法

4.2.1 药物处理及纯化回收小袋虫

4.2.2 总RNA提取及检测

4.2.3 文库构建及测序

4.2.4 转录组数据处理

4.2.5 差异表达基因注释分析

4.3 结果

4.3.1 RNA-seq整体质量评估

4.3.2 样品重复相关性检查

4.3.3 有参分析测序数据比对结果

4.3.4 有参分析差异基因筛选

4.3.5 有参分析差异基因GO富集

4.3.6 有参分析差异基因KEGG通路分析

4.3.7 无参分析数据比对结果

4.3.8 无参分析差异基因筛选

4.3.9 无参分析差异基因GO富集

4.3.10 无参分析差异基因KEGG 代谢通路

4.4 讨论

第5章 结论

参考文献

致谢

攻读学位期间的研究成果