小麦叶片顺序和非顺序衰老转录组数据分析

第一章 文献综述

1.1 选题背景，目的和意义

1.2.1 植物叶片衰老的内源因素

1.2.2 植物叶片衰老的外源因素

1.2.3 植物衰老基因

1.3 顺序型衰老小麦和非顺序衰老小麦研究

1.4 RNA-Seq技术

1.5 基因功能注释

1.6 加权基因共表达网络分析

第二章 小麦叶片非顺序和顺序衰老数字基因表达谱分析

2.1 植物材料

2.2 数据分析

2.2.1 测序数据处理及比较分析

2.2.2 差异基因分析

2.2.3 差异基因富集分析

2.2.4 差异基因RT-qPCR验证

2.3.1 测序结果评估

2.3.2 差异基因的分析

2.3.3 差异表达基因GO富集分析

2.3.4 差异表达基因KEGG 路径富集分析

2.3.4 差异表达基因的RT-qPCR验证

2.4 讨论

第三章 非顺序和顺序衰老小麦加权基因共表达网络构建

3.1 试验材料

3.2 试验方法

3.2.1 WGCNA 构建两种衰老类型小麦在衰老过程中共表达网络

3.2.2 基因网络模块可视化及分析

3.3.1 两种衰老类型小麦加权基因共表达网络的构建

3.3.2 顺序衰老小麦的核心基因

3.3.3 非顺序衰老小麦核心基因的筛选

3.4.1 小麦衰老与转运相关基因的关系

3.4.2 小麦衰老和光合作用相关基因的关系

3.4.3 小麦衰老和其他相关基因的关系

第四章 结论和展望

4.1 结论

4.2 创新点

4.3 展望

参考文献

致谢

个人简历