Mps1抑制剂的分子对接、3D-QSAR及分子动力学模拟的研究

声明

第1章 绪 论

1.1 乳腺癌的概况

1.2 蛋白激酶的简介

1.3 Mps1的简介

1.3.1 Mps1激酶的结构

1.3.2 Mps1激酶的功能

1.3.3 Mps1抑制剂的研究概况

1.4 计算机辅助药物设计的概述

1.5 研究目的和研究方法

第2章 理论基础与计算方法

2.1 定量构效关系方法

2.1.1 三维定量构效关系基本原理

2.1.2 三维定量构效关系的方法

2.2 分子对接

2.2.1 分子对接的基本原理

2.2.2 分子对接的研究步骤

2.3 分子力学

2.3.1 分子力场的描述

2.4 分子动力学

2.4.1 分子动力学模拟的基本理论

2.4.2 积分算法

2.4.3 分子动力学模拟步骤

2.5 结合自由能的计算

2.5.1 基本理论

2.5.2 MM/GBSA和MM/PBSA的原理

第3章 Mps1 分子抑制剂的分子对接和动力学模拟

3.1 引言

3.2 理论方法与细节

3.2.1 初始模型构建

3.2.2 分子对接

3.2.3 复合物分子动力学模拟

3.2.4 结合自由能的计算

3.3 结果讨论

3.3.1 预处理结果分析

3.3.2 分子对接

3.3.3 分子动力学模拟的分析

3.3.4 体系能量的分析

3.3.5 相互作用的分析

3.3.6 复合物结合模式的分析

第4章 Mps1抑制剂三维定量构效关系的研究

4.1 材料与方法

（一） 体系的构建

（二）模型的优化

（三）分子叠合

（四）模型的构建

（五）模型验证

4.2 CoMFA与CoMSIA模型结果分析

4.2 CoMFA与CoMSIA模型三维等势图分析

第5章 结 论

参考文献

作者简介

致 谢