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松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)谷氨酸氯离子通道基因克隆及分析

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摘要

1 文献综述

1.1 松材线虫研究现状

1.1.1 松材线虫形态性状及生活史

1.1.2 松材线虫病的危害与防治

1.2 离子通道研究进展

1.2.1 离子通道研究史

1.2.2 离子通道的特性及分类

1.2.3 谷氨酸氯离子通道的研究进展

1.3 膜片钳技术

1.4 电压钳技术

1.5 论文研究思路

2 材料与方法

2.1 试验材料

2.1.1 供试松材线虫

2.1.2 菌株及质粒

2.1.3 供试细胞

2.1.4 主要试剂

2.1.5 主要仪器设备

2.1.6 常用培养基及储备液

2.1.7 主要数据分析软件

2.1.8 引物和测序

2.2 试验方法

2.2.1 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因的克隆

2.2.2 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因功能验证

3 结果与分析

3.1 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因克隆

3.1.1 松材线虫总RNA的提取结果

3.1.2 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因片段的扩增结果

3.2 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因的生物信息学分析

3.2.1 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因的cDNA测序结果及推测的氨基酸序列

3.2.2 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因氨基酸序列理化性质和亲水性分析

3.2.3 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因编码蛋白结构域分析

3.2.5 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因编码蛋白三级结构预测

3.3 松材线虫谷氨酸氯离子通道基因表达载体构建

3.1.1 松材线虫谷氨酸氯离子通道表达载体构建图

3.3.2 载体片段的扩增结果

3.3.3 目的基因的扩增结果

3.4 细胞转染

3.5 全细胞膜片钳试验

3.6 双电及电压钳试验

4 讨论

4.1 外源表达细胞的选择

4.2 基因功能的验证

5 结论与展望

5.1 结论

5.2 展望

参考文献

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致谢

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摘要

松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)是松林毁灭性病害松材线虫病(Pine Wilt Disease)的病原。目前对松材线虫病的防治主要是利用杀线虫剂进行树干打孔注药。实践表明阿维菌素类化合物对松材线虫具有良好的预防和治疗效果。阿维菌素类杀虫剂的作用靶标是昆虫谷氨酸氯离子通道(Glutamate-gated chloride channel,GluCl)。目前有关松材线虫谷氨酸氯离子通道与阿维菌素类杀虫剂相互作用的报道较少。本研究克隆了松材线虫谷氨酸氯离子通道基因并对其功能进行了初步分析,取得了以下研究结果:  1松材线虫谷氨酸氯离子通道基因克隆及其表达模式分析  1)从松材线虫转录组中获得了3条谷氨酸氯离子通道基因序列,并设计特异引物克隆获得了3条基因序列,将其分别命名为BxCluCl1、BxCluCl2和BxCluCl3。经序列比对之后可知3条谷氨酸氯离子通道基因序列与其他线虫的相似性在40%-70%之间。  2)根据松材线虫谷氨酸氯离子通道氨基酸序列推测了氨基酸分子量、等电点等理化性质及其亲水性。BxCluCl1氨基酸相对分子量约为43.481KD,理论等电点pI为9.45,亲水性平均系数为-0.057;BxCluCl2氨基酸相对分子量约为53.307KD,理论等电点pI为8.61,亲水性平均系数为-0.204;BxCluCl3氨基酸相对分子量约为34.879KD,理论等电点pI为5.91,亲水性平均系数为0.048。  3)根据松材线虫谷氨酸氯离子通道氨基酸序列推测了编码蛋白结构域、二级结构以及三级结构。3条谷氨酸氯离子通道孔道均由五个多肽亚基寡聚而成。且每个亚基都存在4个疏水跨膜区(transmembrane domain,TM)、较长的胞外区(Extracellular domain,ECD)以及M1-M4和介于M3和M4环之间的大的胞内环组成的胞内区(intracellular domain)三部分。  2松材线虫谷氨酸氯离子通道基因在异源表达系统中的表达  使用CHO、HEK293、COS-7以及Sf9细胞异源表达表达了3个谷氨酸氯离子通道基因。在特异性神经递质L-谷氨酸的刺激下,利用膜片钳技术测试3个谷氨酸氯离子通道基因的表达产物对L-谷氨酸的反应,结果显示均不产生反应,推测哺乳动物细胞和昆虫细胞表达系统不能表达谷氨酸氯离子通道或者表达了非功能性谷氨酸氯离子通道,或者可能是需要同时表达两个及以上基因才能引起谷氨酸的门控作用。  初步使用爪蟾卵母细胞异源表达表达了3个谷氨酸氯离子通道基因。在特异性神经递质L-谷氨酸的刺激下,利用电压钳技术测试3个谷氨酸氯离子通道基因的表达产物对L-谷氨酸的反应,初步试验结果显示BxCluCl3对L-谷氨酸有电流反应,BxCluCl1、BxCluCl2对L-谷氨酸无电流反应。  目前,已初步使用爪蟾卵母细胞作为异源表达载体,利用电压钳技术来验证3个松材线虫谷氨酸氯离子通道基因的功能,表明部分克隆基因有功能反应。本课题组将在接下来的工作中对其3个基因进行更进一步的试验去验证其功能,并利用该技术研究不同结构的阿维菌素类化合物与松材线虫谷氨酸氯离子通道亲和力,进一步明确阿维菌素类化合物活性与结构的相关性。

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