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材用云南松种质保存库构建及保存策略研究

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摘要

第一章绪论

1.1.1研究背景

1.1.2目的与意义

1.1.3项目来源与经费支持

1.2国内外研究进展

1.2.1林木种质资源异地保存策略(种质保存库或核心种质库构建策略)研究进展

1.2.2林木种质资源原地保存策略研究进展

1.2.3云南松遗传多样性研究进展

1.3主要研究内容与技术路线

1.3.1主要研究内容

1.3.2技术路线

第二章材用云南松表型性状遗传多样性和遗传结构

2.1研究材料

2.2研究方法

2.2.1表型性状测定

2.2.2数据处理与分析

2.3结果与分析

2.3.1材用云南松各居群18个表型性状的变异分析

2.3.2材用云南松居群间的表型分化估算和Shannon—weaver多样性指数分析

2.3.3依据表型性状的材用云南松居群间的聚类分析

2.4小结

第三章材用云南松SRAP标记遗传多样性和遗传结构

3.1研究材料

3.2研究方法

3.2.1材用云南松干叶DNA提取和检测

3.2.2材用云南松SRAP-PCR反应体系和扩增程序

3.2.3材用云南松SRAP标记的引物筛选

3.2.4材用云南松SRAP-PCR扩增产物检测

3.2.5材用云南松SRAP标记数据分析

3.3结果与分析

3.3.1材用云南松干叶DNA的提取和检测

3.3.2材用云南松SRAP标记的引物筛选

3.3.3材用云南松SRAP-PCR扩增产物荧光标记毛细管电泳检测

3.3.4基于SRAP分子标记的材用云南松遗传多样性参数评价

3.3.5基于SRAP分子标记的材用云南松居群间亲缘关系的聚类分析

3.3.6基于SRAP分子标记的材用云南松遗传多样性的分子方差分析

3.4小结

第四章基于表现型值构建材用云南松种质保存库

4.1研究材料

4.2研究方法

4.2.1表型性状测定

4.2.2表型性状数据标准化

4.2.3种质保存库的构建

4.2.4种质保存库的检测评价

4.2.5种质保存库的确认

4.3结果与分析

4.3.1原种质集与不同抽样比例种质子集性状指标的均值t检验和方差F检验

4.3.2原种质集与不同抽样比例种质子集性状指标的频率分布x2检验

4.3.3原种质集与不同抽样比例种质子集性状指标的表型相关分析

4.3.4原种质集与不同抽样比例种质子集性状指标的表型遗传多样性指数分析

4.3.5不同抽样比例种质子集表型保留比例、均值差异百分率、变异系数变化率、极差符合率、方差差异百分率对比分析

4.3.6种质保存库的确认

4.4小结

第五章基于SRAP分子标记构建材用云南松种质保存库

5.1研究材料

5.2研究方法

5.2.1 SRAP分子标记

5.2.2种质保存库的构建

5.2.3种质保存库的检测评价

5.2.4种质保存库的确认

5.3结果与分析

5.3.1原种质集与不同抽样比例种质子集遗传多样性比较

5.3.2原种质集与不同抽样比例种质子集遗传多样性指标的均值t检验和方差F检验

5.3.3原种质集与不同抽样比例种质子集的相关系数比较

5.3.4种质保存库的确认

5.4小结

第六章整合表型性状和分子标记数据构建材用云南松种质保存库

6.1研究材料

6.2研究方法

6.2.1表型性状测定和表型性状数据标准化

6.2.2 SRAP分子标记

6.2.3种质保存库的构建

6.2.4种质保存库的检测评价

6.2.5种质保存库的确认

6.3结果与分析

6.3.1原种质集与不同抽样比例种质子集数量性状检测评价

6.3.2原种质集与不同抽样比例种质子集分子标记信息检测评价

6.3.3种质保存库的确认

6.4小结

7.1研究材料

7.2研究方法

7.2.1表型性状测定和SRAP分子标记

7.2.2遗传标记捕获曲线的建立

7.2.3 Shannon多样性指数的混合评价参数

7.2.4居群间混合遗传距离

7.3结果与分析

7.3.1材用云南松遗传标记捕获曲线分析

7.3.2材用云南松Shannon多样性指数的混合评价参数分析

7.3.3材用云南松居群间混合遗传足巨离分析

7.4小结

8.1结论

8.2讨论

8.2.1材用云南松遗传多样性和遗传结构

8.2.2材用云南松种质保存库构建(异地保存)策略

8.2.3材用云南松原地保存策略

8.3展望

8.4论文创新点

8.4.1选取具材用特性的优良云南松种质资源群体探讨其保存策略

8.4.2利用整合表型性状和分子标记数据探讨材用云南松保存策略

参考文献

在读期间的学术研究

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摘要

本研究以云南松种源区划为主,结合云南松的地理分布情况,在云南松全分布区内选取干形通直圆满,具有材用代表性的天然居群26个,每个居群选取30棵样株,共计780棵样株进行群体试验。以样株的18个数量性状测定值作为表现型值数据,以样株的SRAP标记信息作为分子标记数据,在分析材用云南松遗传多样性和遗传结构的基础上,探讨其原地保存和异地保存的样本策略,以期解决云南松种质资源保存中样本选取地确定、样本数量等关键技术问题,为云南松优良种质资源的保护和利用提供样本抽取策略的方法依据和种质材料来源。主要研究结果如下:  (1)材用云南松遗传多样性和遗传结构  根据18个数量性状的表现型值和SRAP标记数据,对材用云南松居群的遗传多样性和遗传结构的研究结果,揭示出云南松表型性状在居群内的方差分量百分比(54.23%)大于居群间的方差分量百分比(21.46%),居群间表型方差分化系数为29.02%、表型频率分化系数为0.0855;SRAP标记分析居群间遗传分化系数为0.1013、基因流为4.4357,居群内的方差分量百分比(87%)大于居群间的方差分量百分比(13%)。认为材用云南松在居群间和居群内均表现出多态性,且其遗传多样性主要存在于居群内。  18个表型性状在居群间存在显著差异,多重比较表明,云南双江①、云南龙陵、云南马关、云南曲靖、云南永仁、贵州册亨、贵州水城、云南丽江和西藏察隅9个居群的表型遗传多样性更为丰富;SRAP标记遗传多样性研究表明,四川米易、西藏察隅和云南新平3个居群的遗传多样性更为丰富。研究结果阐明了材用云南松的遗传变异主要存在于居群内,并得出遗传多样性相对丰富的具体居群,为材用云南松种质保存库构建中组内抽样比例的确定和原地保存策略研究中优先保存群体的确定提供理论依据和数据支撑。  (2)材用云南松种质保存库构建策略  分别构建表现型值、SRAP标记信息、整合表现型值和SRAP标记信息三种数据类型各自不同抽样比例的种质子集,研究材用云南松种质保存库构建(异地保存)策略。结果表明以表现型值为基础数据、基于欧氏距离构建的种质子集中,20%抽样比例种质子集的表型遗传多样性指数平均值极显著大于原种质集,且20%抽样比例时,变异系数变化率和方差差异百分率最大、极差符合率和表型保留比例较大、均值差异百分率较小,优于其他3种抽样比例;以SRAP标记信息为基础数据、基于Nei's距离构建的种质子集中,评价参数的均值t检验和方差F检验以及相关系数比较,40%和30%抽样比例优于其他2种抽样比例,考虑种质资源保存的工作量及成本,30%为适宜抽样比例。以整合表现型值和SRAP标记信息为基础数据、基于混合遗传距离构建的种质子集,数量性状评价综合分析,30%抽样比例优于其他3种抽样比例;质量性状评价综合分析,40%禾N30%抽样比例优于其他2种抽样比例;综合两类性状参数评价结果,30%抽样比例优于其他3种抽样比例。  对比三种数据类型及其相应的适宜构建策略所获得的种质保存库的效果,表明整合表现型值和SRAP标记信息采用混合遗传距离的构建策略,优于单独使用表现型值或SRAP标记数据采用其各自适宜遗传距离的构建策略,体现在其种质子集内样株间的变异更大、差异性和频率分布检验更灵敏及种质子集与原种质集的相关性更好。据此提出按地理来源分组、采用混合遗传距离和不加权类平均法聚类、30%抽样比例、改进的最小距离逐步取样法组内取样的策略,是材用云南松种质保存库构建的适宜抽样策略,并构建出包含234株样株的种质保存库,作为材用云南松种质资源异地保存的总体样本。  (3)材用云南松原地保存策略  根据SRAP标记信息,采用多项式回归统计分析技术,建立遗传标记捕获曲线和模型,开展材用云南松原地保存策略研究。结合曲线和模型分析,表明对于多态位点百分率,抽样10-12个群体、每群体抽样20.24株,其代表性可达95%以上。据此,确定原地保存时的样本量策略为,群体样本量12个,群体内个体样本量24株,每群体适宜保存面积5.Ohm2。采用Shannon多样性指数混合评价参数Mmix(I)和混合遗传距离Dmix,对26个居群的遗传多样性进行分析、评价和排序,同时结合26个居群的地理分布和云南松的种源区划,最终确定云南新平、四川米易、西藏察隅、云南香格里拉、云南福贡、云南龙陵、云南丽江、广西乐业②、云南双江①、贵州水城、云南永仁和贵州册亨12个居群为原地保存群体。综上,本研究提出了既包含群体和群体内个体的样本量,又包含需优先保存的群体信息的原地保存策略,在保证群体样本量的前提下,使得保存群体更具针对性和实用性,以利于实现材用云南松优良种质资源永久保存的目的和要求。

著录项

  • 作者

    王晓丽;

  • 作者单位

    中国林业科学研究院;

  • 授予单位 中国林业科学研究院;
  • 学科 森林培育
  • 授予学位 博士
  • 导师姓名 李昆;
  • 年度 2019
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    材用云南松,种质资源,原地保存,异地保存;

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