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【6h】

跨膜蛋白PSGL-1的跨膜区相互作用的分子机制研究

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声明

摘要

符号说明

第一章 绪论

1.1 跨膜蛋白简介

1.2 PSGL-1简介

1.3 跨膜蛋白相互作用模型

1.3.1 GlycophorinA(GPA)和GxxxG motif

1.3.2 极性氨基酸序列

1.3.3 亮氨酸拉链

1.4 影响跨膜蛋白相互作用的重要因素

1.4.1 跨膜区氨基酸序列的长度和位置

1.4.2 极性残基

1.4.3 芳香族氨基酸

1.4.4 带正电残基

1.5 跨膜蛋白相互作用的常用实验检测手段

1.5.1 TOXCAT体系

1.5.2 荧光共振能量转移

1.5.3 色氨酸诱导淬灭(TrIQ)方法

1.6 计算机模拟法表征跨膜蛋白之间的相互作用

1.7 跨膜短肽的应用

1.8 选题的意义及课题的主要内容

1.8.1 选题的意义

1.8.2 课题的主要内容

第二章 跨膜区长度对跨膜蛋白相互作用的影响

2.1 引言

2.2 实验部分

2.2.1 实验仪器与材料

2.2.2 TOXCAT载体的构建

2.2.3 感受态细胞MM39的制备

2.2.4 转化

2.2.5 菌落PCR

2.2.6 CAT活性测定

2.2.7 MalE互补实验

2.2.8 Western blot实验

2.3 实验结果与讨论

2.3.2 PSGL-1跨膜区的野生型TOXCAT载体单克隆验证

2.3.3 PSGL-1不同长度跨膜区的TOXCAT载体测序结果

2.3.4 不同长度跨膜区的CAT活性测定

2.3.5 不同长度跨膜区的MalE互补实验结果

2.3.6 不同长度跨膜区的Western blot实验结果

2.4 本章小结

第三章 亮氨酸拉链模型对跨膜蛋白相互作用的影响

3.1 引言

3.2 实验部分

3.2.1 实验仪器与材料

3.2.2 TOXCAT突变体引物设计

3.2.3 定点突变

3.3 结果与讨论

3.3.1 PSGL-1跨膜区定点突变结果

3.3.2 亮氨酸扫描突变

3.3.3 丙氨酸扫描突变

3.3.4 突变体MalE互补实验结果

3.3.5 突变体Western blot实验结果

3.4 本章小结

第四章 PSGL-1跨膜区相互作用的分子动力学模拟

4.1 引言

4.2 模拟体系构建和参数设定

4.3 实验结果与讨论

4.3.1 PSGL-1-TM野生型在DPPC膜中相互作用的粗粒化模拟

4.3.2 PSGL-1-TM突变体在DPPC膜中相互作用的粗粒化模拟

4.4 本章小结

第五章 结论与展望

参考文献

致谢

研究成果及发表的学术论文

作者和导师简介

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摘要

P-选择素糖蛋白配体-1(PSGL-1),是一种跨膜蛋白,它在白细胞内以二聚体的形式表达。在炎症反应初期,PSGL-1可以通过与血小板以及内皮细胞上的P-selection蛋白相互作用,进而介导白细胞黏附过程。相关研究已经证实,通过PSGL-1跨膜区介导的二聚作用的对于实现其生化功能是必不可少的。目前,关于PSGL-1跨膜区相互作用的机制尚未可知。
  在本论文中,我们采用TOXCAT体系,设计了7种不同序列长度的跨膜区嵌合体,证实了跨膜区序列长度能够影响跨膜蛋白的相互作用。包含320-343这24个氨基酸残基序列的PSGL-WT跨膜螺旋二聚作用最强,选作后续研究的野生型菌种。PSGL-WT的同源二聚能力约为阳性对照GPA的1.5倍,这表明它是一个自身相互作用非常强的二聚体。然后,通过亮氨酸和丙氨酸全扫描突变研究PSGL-1跨膜区相互作用机制,结果综合表明位于(abcdefg)n七肽重复序列的a面的I324,A331,T338以及d面的C320,L327,F334,L341氨基酸突变体会造成PSGL-1-TM二聚能力下降,初步认定PSGL-1的跨膜区相互作用是由a,d面组成的亮氨酸拉链介导的。
  随后,分子动力学模拟方法被用于验证TOXCAT实验结果,同时进一步确认二聚体的相互作用接触面。对野生型序列的粗粒化模拟中,我们得出了PSGL-WT二聚体两个单体的主链之间的距离平稳,距离约7.5(A);形成了一个右手螺旋构象,出现-27°的二面角。另外,通过野生型和a,d面的突变型对比发现,二面角发生明显变化,这与TOXCAT实验结果完全一致。
  综合实验结果证明,PSGL-1跨膜区相互作用是由a,d面组成的亮氨酸拉链介导的。

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