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DNA sequence analysis of a Helicobacter pylori plasmid fragment.

机译:幽门螺杆菌质粒片段的DNA序列分析。

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摘要

The purpose of this study is to determine the nucleotide sequence of a 700 bp plasmid DNA fragment isolated from the gastric pathogen, Helicobacter pylori. The DNA sequence has been analyzed for homology to other plasmid nucleic acid and amino acid sequence.; The 700 bp fragment was subjected to dideoxy chain termination DNA sequence and computer database analysis using DNAsis and PC-Gene program. One open reading frame was identified and the deduced polypeptide was 228 amino acids with predicted molecular weight of 27623. Three prokaryotic genes with short regions of DNA homology were found. However, no ribosome binding site and transcription termination sequences were revealed in the sequence. The 700 bp fragment must be part of an unknown protein. Sequencing the neighboring fragments may provide better identification of this plasmid-encoded protein.
机译:这项研究的目的是确定分离自胃病原体幽门螺杆菌的700 bp质粒DNA片段的核苷酸序列。已经分析了DNA序列与其他质粒核酸和氨基酸序列的同源性。用DNAsis和PC-Gene程序对700bp片段进行双脱氧链终止DNA序列和计算机数据库分析。鉴定出一个开放阅读框,推导的多肽为228个氨基酸,预测分子量为27623。发现了三个具有短DNA同源性的原核基因。但是,序列中没有揭示核糖体结合位点和转录终止序列。 700 bp的片段必须是未知蛋白质的一部分。对相邻片段进行测序可以更好地鉴定该质粒编码的蛋白。

著录项

  • 作者

    Chen, Jie.;

  • 作者单位

    Texas Woman's University.;

  • 授予单位 Texas Woman's University.;
  • 学科 Biology Microbiology.; Biology General.; Biology Molecular.
  • 学位 M.S.
  • 年度 1993
  • 页码 58 p.
  • 总页数 58
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 微生物学;普通生物学;分子遗传学;
  • 关键词

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