基于16S rRNA高通量测序的野生和养殖多鳞白甲鱼肠道微生物群落组成研究

苟妮娜; 钟明智; 王开锋

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为研究多鳞白甲鱼肠道微生物菌群组成及其多样性,采用16S rRNA高通量测序对野生多鳞白甲鱼以及养殖成年健康多鳞白甲鱼肠道内容物进行微生物测序及信息分析.结果表明:不同环境多鳞白甲鱼肠道内容物样品间OTU个数具有一定差别.多鳞白甲鱼肠道菌群主要包括:变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、软壁菌门(Tenericutes)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes).野生样品中优势菌群主要是鲸杆菌属(Cetobacterium),养殖样品中优势菌群主要是乳杆菌属(Lactobacillus).主成分分析则发现,野生多鳞白甲鱼的肠道微生物群落与人工养殖多鳞白甲鱼具有差异.以上结果说明:不同环境间多鳞白甲鱼肠道微生物群落组成及多样性存在差异.

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来源
《西北农业学报》 |2021年第7期|963-970|共8页
作者
苟妮娜; 钟明智; 王开锋;
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作者单位

陕西省动物研究所陕西省秦岭珍稀濒危动物保育重点实验室西安 710032;

西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌 712100;

西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌 712100;

陕西省动物研究所陕西省秦岭珍稀濒危动物保育重点实验室西安 710032;

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正文语种 chi
中图分类渔业资源生态学;
关键词
多鳞白甲鱼; 高通量测序; 肠道微生物; 群落结构;

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