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猪STAB2基因启动子的克隆及转录活性分析

         

摘要

旨在克隆和分析猪STAB2基因启动子及其转录活性.利用基因克隆、双荧光素酶报告基因系统以及生物信息学分析等方法,克隆得到了STAB2基因转录起始位点上游1997 bp的候选启动子序列并对其序列特征进行了分析,同时,构建了不同长度的5′端缺失的重组载体并利用双荧光素酶报告基因系统分析了其荧光素酶活性,进而确定了STAB2基因的核心启动子区域及关键调控区域,并对关键调控区域内的转录因子及其结合位点进行了分析.结果表明:STAB2基因的候选启动子区域内包含4个核心启动子和1个CpG岛;-309--39 bp为STAB2基因的关键调控区域,-1045--309 bp可能存在一个正向调控元件,而-1506--1045 bp可能存在一个负向调控元件;STAB2基因的关键调控区域内包含72个转录因子结合位点,部分转录因子在这一区域具有多个结合位点,如Arnt::Ahr、ZNF354C、Klf4和KLF5,并且,转录因子结合位点之间也存在重合区.为进一步研究猪STAB2基因的表达调控机制以及其在调控猪抗病和肌肉品质中的功能提供了理论依据.

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