谷瘟病菌无毒基因PWL家族检测及变异分析

申浩冉; 白辉; 任世龙; 王璐; 王永芳; 全建章; 董志平; 李志勇

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谷瘟病菌无毒基因PWL家族检测及变异分析

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为了确定不同地区谷瘟病菌群体中无毒基因PWL家族的分布和变异情况,从全国谷子主产区的不同区域采集分离了252株谷瘟病菌单孢菌株,提取基因组DNA,参考目前已知稻瘟病菌中无毒基因PWL家族的核苷酸序列开发合成了5对引物,通过PCR扩增对252株谷瘟病菌进行PWL家族基因检测,并对扩增片段进行测序分析.结果表明,252个谷瘟病菌菌株都不包含PWL1基因,65个菌株包含出PWL2基因,扩增率25.8％,252个菌株都包含PWL3与PWL4基因,扩增率100％.谷瘟病菌PWL3基因与稻瘟病菌中同源基因相比,在基因编码区存在849 bp的碱基插入,插入片段与non-LTR retrotransposon:MGL的相似度为96.7％,利用此差异可通过PCR技术快速区分谷瘟病菌与稻瘟病菌.谷瘟病菌PWL2基因存在多处单核苷酸变异,通过分析将其划分14个单倍型,分别为P1～P14.单倍型P1占绝对优势包含46个菌株,以此为基础衍生出其他主要单倍型,其次为单倍型P12包含7个菌株,并且多地区都存在特异性单倍型,说明我国谷瘟病菌种群具有较高的遗传多样性.谷瘟病菌中不存在PWL1无毒基因,PWL2无毒基因仅存在部分菌株中,PWL3和PWL4无毒基因存在所有谷瘟菌株中,PWL3和PWL4无毒基因对应的抗病基因在谷子上有重要的应用价值.

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来源
《华北农学报》 |2020年第3期|178-183|共6页
作者
申浩冉; 白辉; 任世龙; 王璐; 王永芳; 全建章; 董志平; 李志勇;
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作者单位

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室河北石家庄 050035;

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正文语种 chi
中图分类病毒;
关键词
谷子; 谷瘟病菌; PWL基因家族; 基因克隆; 无毒基因;

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