水稻半矮秆基因iga-1的鉴定及精细定位

郭涛; 霍兴; 饶得花; 刘永柱; 张建国; 陈志强; 王慧

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水稻半矮秆基因iga-1的鉴定及精细定位

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A semidwarf gene iga-1 of rice (Oryza sativa L.) by mutagenesis of outer space treatment from Texianzhan 13 was identified. The dwarf lines CHA-2 and CHA-2N which carried iga-1 showed great variation in agronomic traits. On the basis of the internode length of CHA-2 and CHA-2N, the mutant belongs to the dn type of dwarfing. GA3 treatment, endo-GA3 measurement and α-amylase activity analysis in endosperm showed that iga-1 is independent of gibberellin acid. Using a large F2 population derived from a cross between the CHA-2 and an japonica rice variety, 02428, the iga-1 gene was fine mapped into a 32.01 kb physical distance between two InDel markers, DL18 and DL19 on chromosome 5, where five open reading frames were predicted,one of which was the rice gibberellin-insensitive dwarf mutant gene D1. Sequence analysis showed that no variation in D1 locus was detected among CHA-2, CHA-2N and Texianzhan 13. Thus, D1 can not be the candidate gene of iga-1. Comparing the other dwarf genes on chromosome 5 showed that iga-1 is possibly allelic to the semidwarf gene sd-7.%在前期通过空间诱变获得半矮秆隐性突变基因iga-1的基础上,进一步对iga-1进行鉴定.农艺性状调查表明携带iga-1的矮秆株系CHA-2、CHA-2N与原种特籼占13相比存在明显变异.节间长度测量显示CHA-2、CHA-2N节间比例正常,属dn型.外源GA3处理、内源GA3测定和α-淀粉酶活性检测揭示iga-1与GA3调控无关.利用CHA-2与粳稻品种02428杂交获得的F2群体将iga-1定位在水稻第5染色体两个InDel标记DL18和DL19间32.01 kb的物理距离内.该区域有5个阅读框架,其中包括赤霉素信号传导调控基因D1.序列分析表明CHA-2、CHA-2N和特籼占13在D1位点上基因组序列不存在差异,推测D1并非iga-1的候选基因.比较水稻第5染色体上其他矮秆基因发现iga-1可能与半矮秆基因sd-7来自同一位点.

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来源
《作物学报》 |2011年第6期|955-964|共10页
作者
郭涛; 霍兴; 饶得花; 刘永柱; 张建国; 陈志强; 王慧;
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作者单位

华南农业大学/国家植物航天育种工程技术研究中心,广东广州510642;

华南农业大学/国家植物航天育种工程技术研究中心,广东广州510642;

华南农业大学/国家植物航天育种工程技术研究中心,广东广州510642;

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华南农业大学/国家植物航天育种工程技术研究中心,广东广州510642;

华南农业大学/国家植物航天育种工程技术研究中心,广东广州510642;

华南农业大学/国家植物航天育种工程技术研究中心,广东广州510642;

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正文语种 chi
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关键词
水稻; 半矮秆突变体; iga-1基因; 精细定位;

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