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分离克隆苎麻CCoAOMT基因部分序列

         

摘要

以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud]为材料,研究木质素代谢的关键酶苎麻咖啡酰辅酶A甲基转移酶基因序列.分离了高纯度RNA和DNA.以RNA为模板,用简并引物以RT-PCR的方法,克隆了苎麻CCoAOMT基因cDNA部分序列,长度为486bp,编码162个氨基酸残基.此cDNA序列为苎麻植物中首次克隆的(caffeoyl-CoA 3-O-methyltransferase,CCoAOMT)新基因序列.GenBank注册,登录号为AY651026.以苎麻4个栽培品种基因组DNA为模板,经温度梯度PCR条件优化,获得苎麻CCoAOMT基因的部分基因组序列,GenBank注册号为AY818191(湘苎3号,922 bp)、AY822619(圆麻,915 bp)、AY822620(芦竹青,914 bp)、AY822622(青麻,914bp).生物信息学分析结果发现,苎麻4个栽培品种的CCoAOMT基因基因组DNA片段序列有一定的差异.

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