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不同氮水平下水稻钾吸收及全基因组关联分析

         

摘要

以业已完成深度重测序的134份水稻地方种质资源为材料,在大田栽培条件下按不施氮(N0),施96 kg hm–2纯氮(N1)和施192 kg hm–2纯氮(N2)3种氮肥水平,检测了分蘖盛期植株的钾含量、植株干重和钾积累.结果表明,水稻钾含量、植株干重和钾积累在N0、N1、N2三种氮肥处理下均呈正态分布,表型变异丰富.植株干重和钾积累与施氮量呈极显著正相关,钾含量与施氮量相关性不显著;钾含量与植株干重呈负相关,钾含量与钾积累相关性不显著,而植株干重与钾积累呈极显著正相关.在3个施氮水平下,籼稻的钾含量极显著低于粳稻,籼稻的干重和钾积累都极显著高于粳稻.全基因组关联分析发现,在3个氮肥水平下检测到12个显著相关位点,其中钾积累、钾含量和植株干重的显著相关位点分别有2、5和5个.在N1水平下,位于第6染色体上与钾含量相关的SNP(Chr6_1,524,776)的显著性峰候选区包含与钾离子转运蛋白互作的RUPO基因.根据钾含量的差异,鉴定出3个钾含量与低氮响应有关的SNP位点,1个位点与高氮响应有关,而位于第10染色体上的显著性位点Chr10_2,822,026对低氮和高氮均有响应,该区域的4个候选基因的表达在不同氮水平间存在差异.

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