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应用独立成分分析方法预测CTL表位

         

摘要

基于独立成分分析方法分别采用3 z-scale和5 z-scale氨基酸结构描述符,建立了抗原肽与MHC分子(major histocompatibility complex,MHC)相互作用结合的定量构效关系模型.该两个模型训练集样本数是316,预测集样本数是786.结果表明:3 z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.3%,0.70;5 z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.90/0,0.79.本文建立CTL表位预测模型对进一步了解抗原肽与MHC I类分子相互作用机理具有一定的帮助.

著录项

  • 来源
    《化学学报》 |2010年第18期|1821-1828|共8页
  • 作者单位

    大连理工大学高科技研究院;

    大连;

    116023;

    大连理工大学物理与光电工程学院;

    大连;

    116023;

    大连理工大学高科技研究院;

    大连;

    116023;

    大连交通大学理学院;

    大连;

    116028;

    大连理工大学高科技研究院;

    大连;

    116023;

    大连理工大学物理与光电工程学院;

    大连;

    116023;

    大连理工大学高科技研究院;

    大连;

    116023;

    大连理工大学高科技研究院;

    大连;

    116023;

    大连理工大学物理与光电工程学院;

    大连;

    116023;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    CTL表位; 独立成分分析; 氨基酸描述符; 定量构效关系;

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