基于线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究

程汉良; 彭永兴; 董志国; 易乐飞; 孟学平; 申欣; 周旻纯; 陈冬勤

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基于线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究

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对21种帘蛤科贝类线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为707 bp(含引物),序列A+T含量(62.4％-67.8％)明显高于G+C含量.物种间共有变异位点379个,其中简约信息位点334个；此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点100个.以COI基因片段序列为标记,用中国蛤蜊(Mactra chinensis)作外群,构建了35种帘蛤科贝类(其中14种贝类COI序列从GenBank下载)的系统发生树,结合拓扑结构分析和序列比对分析,结果表明:支持将短文蛤(Meretrix petechinalis)和丽文蛤(M.lusoria)订为文蛤(M.meretrix)的同物异名的观点,建议将丽文蛤和短文蛤订为文蛤的地理亚种；支持将薄片镜蛤(Dosinia corrugata)和D.angulosa订为2个独立种的观点；认为将波纹巴非蛤(Paphia undulata)和织锦巴非蛤(P.textile)订为2个独立种是合适的.COI基因序列含有丰富的遗传信息,适合作为帘蛤科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记.

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来源
《生态学报》 |2013年第9期|2744-2753|共10页
作者
程汉良; 彭永兴; 董志国; 易乐飞; 孟学平; 申欣; 周旻纯; 陈冬勤;
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作者单位

淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港222005;

淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港222005;

淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港222005;

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淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港222005;

淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港222005;

淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港222005;

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正文语种 chi
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关键词
帘蛤科; 线粒体DNA; 细胞色素c氧化酶亚基I; 系统发生;

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