鲢中华鳋线粒体基因组的基因组成及特征分析

彭国祥; 高谦; 宋英; 赵琴平; 罗宇良; 聂品

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研究旨在测定隶属桡足亚纲(Copepoda)杯口水蚤目(Poicilostomatoida)的寄生甲壳动物鲢中华鳋(Sinergasilus polycolpus)线粒体DNA(mtDNA)序列,分析其结构特征,为节肢动物系统进化研究积累资料.利用简并引物扩增鲢中华鳋Cyt b和CO I基因片断,据此设计特异性引物Long-PCR扩增鲢中华鳋mtDNA序列,拼接后得到12917 bp的序列(GenBank登录号为EU621723).这段序列A、T、C、G碱基含量分别为35.0%、35.8%、14.0%和15.2%,GC-Skew和AT-Skew值分别为0.041和-0.011.通过序列同源性和结构分析,鉴定了35个基因,包括13个蛋白编码基因、21个tRNA基因和1个12s rRNA基因.推测未能扩增到的片段包含16S rRNA、tRNA~(Arg)和tRNA~(Thr)基因以及控制区序列.tRNA基因长度在54-63bp之间,均可折叠成典型的三叶草结构,但TψC臂长度变化较大,其中有三个缺少TψC臂.35个基因中.4个蛋白质编码基因和7个tRNA基因位于N链,其余的位于J链.基因间重叠有12处,重叠碱基量达159 bp.进一步研究桡足类及相关类群线粒体基因组的遗传特征将有助于揭示和阐明桡足类系统发育关系.

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来源
《水生生物学报》 |2010年第1期|177-183|共7页
作者
彭国祥; 高谦; 宋英; 赵琴平; 罗宇良; 聂品;
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作者单位

华中农业大学水产学院,武汉,430070;

中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072;

中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072;

中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072;

武汉大学基础医学院,武汉,430071;

华中农业大学水产学院,武汉,430070;

中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类目的基因的获得;
关键词
鲢中华鳋; 桡足类; 线粒体基因组; Long-PCR扩增;

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