基于线粒体基因组全序列的鲟形目鱼类(Pisces:Acipenseriformes)的分子系统发育重建

程佩琳; 俞丹; 刘焕章; 杜浩; 危起伟

首页> 中文期刊> 《水生生物学报》 >基于线粒体基因组全序列的鲟形目鱼类(Pisces:Acipenseriformes)的分子系统发育重建

基于线粒体基因组全序列的鲟形目鱼类(Pisces:Acipenseriformes)的分子系统发育重建

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

为厘清鲟形目鱼类的系统发育,研究新测定了中华鲟(Acipenser sinensis)、长江鲟(A.dabryanus)、短吻鲟(A.brevirostrum)、纳氏鲟(A.naccarii)、鳇(Huso dauricus)和匙吻鲟(Polyodon spathula)共6种鲟类的线粒体全基因组序列.联合已测的17种鲟类的线粒体基因组数据,利用最大似然法和贝叶斯法重建了鲟形目鱼类的分子系统发育关系,并采用似然值检验对不同的树拓扑结构进行了评价.结果表明,6种新测鲟类的线粒体基因组大小为16521—16766 bp,编码13个蛋白质编码基因、22个转运RNA基因和2个核糖体基因,与大多数已测的鲟类的线粒体基因组结构高度相似.基于23种鲟形目鱼类线粒体基因组数据,系统发育分析的结果表明:(1)鲟形目的两个科,匙吻鲟科(Polyodontidae)和鲟科(Acipenseridae)均为单系;(2)鲟科的内部亲缘关系复杂,鲟属和鳇属的物种均不构成单系群.鲟科鱼类按分子系统发育重建结果可以分为3个类群:尖吻鲟类(A.sturio-A.oxyrinchus clade)、大西洋鲟类(Atlantic clade)和太平洋鲟类(Pacific clade).树拓扑结构的检验结果表明,鲟科的系统发育关系为(尖吻鲟类(太平洋鲟类,大西洋鲟类)).铲鲟属(Scaphirhynchus)是大西洋鲟类的基部类群.研究也说明线粒体基因组数据在鲟形目鱼类系统与进化研究方面具有重要应用价值.

著录项

来源
《水生生物学报》 |2021年第3期|1-22|共22页
作者
程佩琳; 俞丹; 刘焕章; 杜浩; 危起伟;
展开▼
作者单位

中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室武汉 430223;

中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室武汉 430072;

中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室武汉 430072;

中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室武汉 430223;

中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室武汉 430223;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类真口亚纲;
关键词
线粒体基因组; 鲟类; 系统发育分析; 最大似然法; 贝叶斯推断; 拓扑结构检验;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于COII全基因序列对蜻科部分昆虫的分子系统发育分析(蜻蜓目:差翅亚目) [J] . 查岭生 ,张大治 ,郑哲民 . 宁夏大学学报（自然科学版） . 2009,第004期
2. 鲟形目线粒体16S rRNA的部分序列变异及系统发生 [J] . 王荻 ,李绍戊 ,曲秋芝 . 吉首大学学报（自然科学版） . 2010,第006期
3. 中国鱼类名录Ⅹ Ⅲ--鲽形目、鲀形目、海蛾鱼目、鮟鱇目 [J] . 李明德 ,张世禄 ,王迎 . 海洋通报 . 2003,第006期
4. 基于CO I与ITS序列的杂鳞库蚊复组(双翅目:蚊科)分子系统发育 [J] . 赵文静 ,张春林 ,陈汉彬 . 环境昆虫学报 . 2016,第004期
5. 基于18S rDNA序列的涡虫纲三肠目分子系统发育研究 [J] . 付瑞敏 ,蔺芳 ,常慧萍 . 广东农业科学 . 2012,第010期
6. 基于生长激素基因cDNA序列的鲽形目鱼类系统进化分析 [C] . 刘滨 ,雷霁霖 ,臧晓南 . 2008年全国海水养殖学术研讨会 . 2008
7. 白鲟、达氏鲟线粒体DNA全序列及鲟形目分子进化研究 [A] . 汪登强 . 2004

基于线粒体基因组全序列的鲟形目鱼类(Pisces:Acipenseriformes)的分子系统发育重建

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅