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首页> 中文期刊> 《微生物学报》 >软腐白菜细菌群落结构多样性与生长环境的相关性

软腐白菜细菌群落结构多样性与生长环境的相关性

         
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摘要

【目的】通过对比分析不同生境白菜软腐病变组织与根系土壤相关细菌的群落结构,探讨白菜软腐细菌种群的多样性,以及与生境土壤细菌种群的相关性。【方法】样品采自河南省2个不同生态型白菜田,以成熟白菜软腐组织及病株根系土壤为目标,利用模拟原环境的培养基成分和条件,对样品中的细菌进行高通量分离培养和细胞16S rRNA基因序列比对分析,获得各样品细菌种群结构及其丰度,进而对各样品的优势菌群进行对比分析。【结果】两种不同生境白菜软腐组织细菌总量M05T为4.0×108 cell/g、Q2T为1.2×1011 cell/g,分别获得纯菌56株和85株。M05T优势菌为萎蔫短小杆菌萎蔫亚种(Curtobacteriumflaccumfaciens pv.Flaccumfaciens);Q2T优势菌为假单胞菌(Pseudomonas spp.)(栖木槿假单胞菌(P.hibiscicola)、台湾假单胞菌(P.taiwanensis)、托木尔假单胞菌(P.tuomuerensis)、莫塞尔假单胞菌(P.mosselii))。根系土壤细菌总量M05S为2.7×105 cell/g、Q2S为6.2×107 cell/g,分别获得纯菌36株和70株。M05S优势菌为巨大芽胞杆菌(Bacillus megatherium);Q2S优势菌为假单胞菌(Pseudomonas spp.)(香鱼假单胞菌(P.plecoglossicida)、栖木槿假单胞菌(P.hibiscicola)、类黄色假单胞菌(P.parafulva)、蒙氏假单胞菌(P.monteilii)、膝形假单胞菌(P.geniculata))。【结论】依据不同生境的白菜软腐组织和根系土壤细菌群落结构对比分析,认为白菜软腐菌可能具有多样性和多种致病来源,本研究为软腐病多种防治措施的制定提供基础研究和菌种资源。

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