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华癸中生根瘤菌质粒复制基因repC的克隆与鉴定

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【目的】repC为质粒复制必需的起始蛋白基因。本研究旨在对华癸中生根瘤菌菌株HN3015及其质粒消除突变株进行repC基因的克隆和鉴定。【方法】采用通用引物RC1和RC3进行repC基因的PCR扩增,扩增产物克隆到载体pMD-18T,然后测序。利用Southern杂交对repC基因定位。利用在线软件分析基因的序列特征,BLAST工具进行同源性搜索;ExPASy推断其氨基酸的序列;ClustalW进行同源核苷酸和氨基酸序列的多重比较分析;Predict Protein进行蛋白二级结构分析。【结果】供试菌株均扩出了750bp左右的repC序列。Southern杂交结果显示:repC基因在每个供试菌株中只存在于一个质粒上。【结论】生物信息学分析结果表明:供试华癸中生根瘤菌菌株的repC序列相似性高达100%,但与其它根瘤菌的repC基因有明显差异。本研究对深入阐明华癸中生根瘤菌质粒复制机制具有一定参考价值。

著录项

来源
《微生物学报》 |2009年第11期|1465-1469|共5页
作者
胡国元; 王善明; 李伟伟; 李友国;
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作者单位

武汉工程大学绿色化工过程省部共建教育部重点实验室;

武汉430073;

华中农业大学农业微生物学国家重点实验室;

武汉430070;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类土壤微生物学;
关键词
华癸中生根瘤菌; repC; PCR扩增; 鉴定;

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