应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究

石鹏君; 柏映国; 袁铁铮; 姚斌; 范云六

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采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析.研究结果显示 rpo B DGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有利于分析瘤胃细菌群落组成.从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性,种内个体间相似性明显高于种间相似性,这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素.同时进行了部分优势细菌16S rDNA基因V6-V8区序列的系统发育分析.基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97%,余下的克隆序列相似性在89%～96%之间,其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌.

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来源
《微生物学报》 |2007年第2期|285-289|共5页
作者
石鹏君; 柏映国; 袁铁铮; 姚斌; 范云六;
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作者单位

中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081;

中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081;

中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081;

中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081;

中国农业科学院,生物技术研究所,北京,100081;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类微生物学;
关键词
DGGE; 16S rDNA基因; 编码RNA聚合酶β亚基(rpoB)基因; 瘤胃细菌; 遗传多样性;

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