基于COⅠ基因片段的中国南部沿海近亲拟相手蟹的群体遗传多样性研究

杨明柳; 徐岩; 高霆炜; 潘红平; 吴斌; 阎冰

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基于COⅠ基因片段的中国南部沿海近亲拟相手蟹的群体遗传多样性研究

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为了研究我国南部沿海近亲拟相手蟹(Parasesarma affine)的群体遗传结构,本研究对12个地理群体共222个个体的线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段进行了分析。结果表明,612 bp的COⅠ基因片段检测到34个变异位点,共定义了40个单倍型,其中Hap2为12个群体的共享单倍型,占个体总数的69.81%。总群体的单倍型多样性水平Hd为0.5089,核苷酸多样性水平Pi为0.001126,表现出中等水平的Hd和低水平的Pi。单倍型邻接发育树和单倍型中介网络图没有形成明显的地理系谱结构。近亲拟相手蟹群体内的遗传距离为0.00036~0.00173,群体间的遗传距离为0.00048~0.00172。群体间的遗传分化系数(Fst)和分子方差分析(AMOVA)结果表明,近亲拟相手蟹群体遗传分化水平低,其变异主要来自群体内。中性检验和核苷酸不配对分布结果提示,近亲拟相手蟹近期经历了群体扩张事件,扩张时间大约发生于5.1万年前的更新世晚期。研究表明,较长的幼虫浮游期以及海洋环境中缺少影响群体扩散的屏障可能是近亲拟相手蟹各地理群体间能进行广泛的基因交流,从而表现出较低的遗传分化水平的重要原因,更新世的剧烈气候变迁亦可能对其群体的遗传结构和分布格局产生影响。研究结果为近亲拟相手蟹自然资源的保护及合理开发利用提供了一定理论依据。

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来源
《海洋学报》 |2021年第2期|105-115|共11页
作者
杨明柳; 徐岩; 高霆炜; 潘红平; 吴斌; 阎冰;
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作者单位

广西科学院广西红树林研究中心广西红树林保护与利用重点实验室;

广西北海536007;

广西大学动物科学技术学院;

广西南宁530005;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类群体遗传学;
关键词
近亲拟相手蟹; COⅠ基因; 遗传多样性; 遗传结构;

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