羟基加成反应对A-T碱基对结构和质子转移过程的影响

史俊友; 董丽花; 刘永军

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羟基加成反应对A-T碱基对结构和质子转移过程的影响

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应用密度泛函理论在B3LYP/6-31+4-G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)水平上对羟基化碱基对A-T的结构进行了研究,经计算共得到8种稳定的羟基化加成产物,其能量的相对顺序为8OHA-T＜A-T6OH＜A-T5OH＜2OHA-T＜4OHA-T＜5OHA-T＜A-T2OH＜A-T4OH(数字表示羟基加成进攻的原子在腺嘌呤或胸腺嘧啶中的编号),这与其加成反应前后结构变化的大小密切相关.当羟基对腺嘌呤端进行加成时,A-T间的相互作用能略有增加,而当羟基对胸腺嘧啶进行加成时,A-T之间的相互作用能略有减小.另外,还以能量较低的加成产物8OHA-T和A-T6OH为例对羟基化碱基对中A和T之间的质子转移过程进行了研究,结果表明羟基化产物中A与T之间的质子转移机理由未加成前的分步双质子转移变为协同双质子转移,且其势垒低于未加成的A-T发生第一步(决速步骤)质子转移的势垒.

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来源
《物理化学学报》 |2010年第12期|3329-3336|共8页
作者
史俊友; 董丽花; 刘永军;
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作者单位

中国科学院西北高原生物研究所,西宁,810001;

中国科学院研究生院,北京,100049;

中国科学院西北高原生物研究所,西宁,810001;

中国科学院研究生院,北京,100049;

中国科学院西北高原生物研究所,西宁,810001;

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正文语种 chi
中图分类结构化学;
关键词
密度泛函理论; 碱基对; 羟基化; 质子转移; 单电子占据轨道;

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