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甘油水溶液氢键特性的分子动力学模拟

         

摘要

为了研究低温保护剂溶液的结构和物理化学特性,以甘油为保护剂,采用分子动力学方法,对不同浓度的甘油和水的二元体系进行了模拟.得到了不同浓度的甘油水溶液在2 ns内的分子动力学运动轨迹,通过对后1 ns内运动轨迹的分析,得到了各个原子对的径向分布函数和甘油分子的构型分布.根据氢键的图形定义.分析了氢键的结构和动力学特性.计算了不同浓度下体系中平均每个原子(O和H)和分子(甘油和水)参与氢键个数的百分比分布及其平均值.同时还计算了所有氢键、水分子之间的氢键以及甘油与水分子之间的氢键的生存周期.

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