基于cpDNA trnL-F序列数据分析海南陆均松种群的冰期后扩张

苏应娟; 王艇; 陈国培; 孙宇飞; 江宇; 邓锋; 王伯荪

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基于cpDNA trnL-F序列数据分析海南陆均松种群的冰期后扩张

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针对热带树种陆均松Dacrydium pierrei de Laubenfels分布在海南的12个天然种群进行取样,测定了叶绿体DNA(cpDNA)trnL-F非编码区序列。序列长度介于868—876 bp.显示出长度多态性。碱基组成A+T含量较高,百分比值为64.17%-64.95%。通过统计简约算法共鉴定出30个单倍型。根据种群间分化度FST(=0.00)、基因流Nm(介于1.92—2.50)、AMOVA(24.17%的遗传变异发生在种群间,P>0.05)以及邻接树中单倍型的分支式样,发现海南的陆均松种群尚未发生遗传分化。另一方面,依统计简约算法构建的单倍型网图具“星状”特征,而且邻接树中多数单倍型合并于树的顶端。这些基因谱系结果提示海南陆均松种群在近期历史上发生过种群扩张。Tajima的D检验和错配分析结果也支持这种推测。结合地质和古孢粉学证据,认为残存于“避难所”的陆均松种群在全新世时,伴随全球气候转暖,在海南岛内可能实行了扩张。

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来源
《中山大学学报：自然科学版（中英文）》 |2005年第5期|70-74|共5页
作者
苏应娟; 王艇; 陈国培; 孙宇飞; 江宇; 邓锋; 王伯荪;
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作者单位

中山大学生命科学学院;

中国科学院武汉植物园;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 Q949.662;
关键词
陆均松Dacrydium; pierrei; de; Laubenfels; cpDNA; trnL-F非编码序列; 单倍型; 遗传分化; 种群扩张;

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