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海南竹柏扁枝植原体基于16S$rRNA和tuf基因的分类及系统进化分析

         

摘要

对采自海南省万宁市的表现竹柏扁枝病的竹柏植株总DNA进行植原体16S)rRNA基因和tuf基因克隆、测序,分别获得竹柏扁枝植原体16S)rRNA基因(1)806)bp,GenBank登录号:KJ848639)和tuf基因(845)bp,GenBank登录号:KX645669)片段。对竹柏扁枝植原体16S)rRNA基因序列进行虚拟RFLP分析,结果表明,竹柏扁枝植原体属于花生丛枝植原体组U亚组(16SrII-U)成员(相似系数为1.00)。对tuf基因进行序列比对和系统进化分析,结果表明,竹柏扁枝植原体与同属16SrII组的植原体亲缘关系最近,其次为16SrI组植原体。本研究从亚组水平上确定了竹柏扁枝植原体的分类地位,并克隆分析了竹柏扁枝植原体的tuf基因,为竹柏扁枝植原体的系统分类和病害防控提供了基础信息。

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