云南省临沧市猪戊型肝炎病毒流行株遗传进化分析

杨国琴; 王国君; 宋春莲; 蔡懿琳; 武鑫; 柴俊; 李文贵; 朱培英

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猪是人兽共患病病原戊型肝炎病毒(HEV)Ⅲ、IV基因型的重要贮存宿主。为了解云南省临沧市猪HEV的遗传进化情况,从规模猪场、猪散养户以及猪屠宰场,随机采集粪便153份、肝脏36份和胆汁54份,采用巢氏PCR进行HEV ORF2基因片段扩增、克隆、测序和生物信息学分析。结果显示:在243份样品中,检出137 bp目标片段阳性61份,阳性率为25.1%(61/243);对检出的阳性样品进行ORF2部分序列扩增,得到6份348 bp目标片段。6份348 bp目标片段间的核苷酸同源性为86.0%~95.6%,均为基因IV型;与HEVI-VⅢ型代表株的同源性分别为75.0%~81.7%、72.7%~77.0%、72.7%~79.3%、80.5%~94.1%、75.7%~80.7%、75.0%~81.0%、73.3%~80.3%和71.3%~76.1%,与我国人源代表毒株AJ272108BeijingHuman的同源性为81.3%~87.7%;基因亚型分析显示,6份348 bp目标片段中,除1份是4b亚型外,其他5份都属于4a亚型。结果表明,临沧市猪群中存在人兽共患病病原HEV基因Ⅳ型流行,且有通过肝脏、胆汁等产品感染传播的潜在风险,因此该地区应该重视猪HEV的公共卫生学意义。

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来源
《中国动物检疫》 |2023年第8期|28-33|共6页
作者
杨国琴; 王国君; 宋春莲; 蔡懿琳; 武鑫; 柴俊; 李文贵; 朱培英;
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作者单位

滇西科技师范学院生物技术与工程学院;

云南农业大学动物医学院;

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正文语种 chi
中图分类家畜流行病学、防疫;
关键词
猪戊型肝炎; 人兽共患病; 同源性分析; 公共卫生;

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