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两株传染性造血器官坏死病病毒的分离及其糖蛋白基因序列分析

         
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摘要

The genetic evolution analysis was conducted for the glycoprotein genes in two isolated strains designated as 20101008 and 20101032 respectively of infectious hematopoietic necrosis virus（IHNV）in order to reveal the phylogenetic relationships of our strains and other strains in different countries and regions.The glycoprotein genes were amplified by RT-PCR and sequenced after being cloned directly into the pMD18-T.The sequences of G genes of 20101008 and 20101032 were compared with the sequences of other IHNV strains in GenBank by DNAStar and MEGA4.0 software.The results showed that the nucleotide and the deduced amino acid identities on G gene of our two strains were 98% and 81.9% respectively.Further analysis of the deduced amino acid sequences indicated 35 and 20 of amino acid residues of G gene were substituted in 20101008 and 20101032.They shared closer identity with strains isolated from Japan and South Korea,and the rate of nucleotide and amino acid homology of G gene were 93.3%～96.4% and 75.9%～84.6% respectively.The two strains 20101008 and 20101032 had the closest genetic relatives and belonged to the same branch and they belonged to genotype U.However,the G gene diverges from known strains at either nucleotide level or amino acid level.%对所分离编号为20101008和20101032的两株传染性造血器官坏死病病毒（IHNV）的糖蛋白编码基因进行遗传进化分析,以揭示我国毒株与其他不同国家和地区毒株间的遗传进化关系。以反转录RCR（RT-PCR）法扩增其糖蛋白（G）编码基因,然后克隆入PMD-18T载体并测序。应用DNAStar和MEGA4.0软件,将20101008和20101032的G基因与多株GenBank中已发表的IHNV毒株相应基因进行比较。结果表明两株病毒间G编码基因的核苷酸和推导出来的氨基酸同源性分别为98%和81.9%,其氨基酸序列分别发生了35和20处氨基酸的替换。20101008和20101032与日本、韩国分离株同源性较高,核苷酸及推导出来的氨基酸同源性分别为93.3%～96.4%和75.9%～84.6%;两株病毒在进化关系上亲缘关系最近,属于同一分支,均为基因U型传染性造血器官坏死病病毒,但其G基因的核苷酸序列以及推导出来的氨基酸序列与已知的基因U型IHNV都有一定的差异。

著录项

  • 来源
    《中国动物检疫》 |2012年第1期|37-41|共5页
  • 作者

    申斯思; 郑晓聪; 刘荭; 史秀杰; 贾鹏; 兰文升; 何俊强; 张朋; 余剑敏; 杜娟; 肖启明; 康林;

  • 作者单位

    湖南农业大学生物安全科技学院,湖南长沙410128;

    深圳市外来有害生物重点实验室,广东深圳518045／深圳出入境检验检疫局,广东深圳518045;

    深圳市外来有害生物重点实验室,广东深圳518045／深圳出入境检验检疫局,广东深圳518045;

    深圳市外来有害生物重点实验室,广东深圳518045／深圳出入境检验检疫局,广东深圳518045;

    深圳市外来有害生物重点实验室,广东深圳518045／深圳出入境检验检疫局,广东深圳518045;

    深圳市外来有害生物重点实验室,广东深圳518045／深圳出入境检验检疫局,广东深圳518045;

    深圳市外来有害生物重点实验室,广东深圳518045／深圳出入境检验检疫局,广东深圳518045;

    华中农业大学水产学院,湖北武汉430070;

    华中农业大学水产学院,湖北武汉430070;

    华中农业大学水产学院,湖北武汉430070;

    湖南农业大学生物安全科技学院,湖南长沙410128;

    深圳市外来有害生物重点实验室,广东深圳518045／深圳出入境检验检疫局,广东深圳518045;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S941.414;
  • 关键词

    传染性造血器官坏死病病毒; 糖蛋白; 同源性; 进化分析;

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