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口蹄疫病毒VP1基因密码子偏好性分析

         

摘要

VP1蛋白是口蹄疫病毒(FMDV)的主要结构蛋白,可诱导机体产生中和抗体以及激发保护性免疫应答.为探究VP1基因密码子偏好性,筛选出其最佳体外表达系统,使用Visual Gene Developer、CodonW、GraphPad Prism等软件,对VP1基因进行密码子偏好性分析,同时将VP1基因密码子使用频率与大肠杆菌、毕赤酵母、昆虫杆状病毒和哺乳动物细胞表达系统作了比较.结果显示,VP1基因的CAI为0.21,ENC为55.43,GC3S为65.26%,表明该基因密码子使用偏好较弱并且密码子偏好以G/C碱基结尾.结合VP1基因与各表达系统密码子使用频率比值,发现其与昆虫杆状病毒表达系统频率比值差异最小且CAI最大,因此推断昆虫杆状病毒表达系统是FMDV VP1基因最适体外表达系统.本研究为FMDV亚单位疫苗研制等提供了技术基础.

著录项

  • 来源
    《中国动物检疫》 |2021年第4期|116-123|共8页
  • 作者单位

    内蒙古农业大学兽医学院 内蒙古呼和浩特 010018;

    通辽市家畜繁育指导站 内蒙古通辽 028000;

    内蒙古农业大学兽医学院 内蒙古呼和浩特 010018;

    额尔克哈什哈苏木综合保障和技术推广中心 内蒙古阿拉善 750300;

    内蒙古必威安泰生物科技有限公司 内蒙古呼和浩特 011500;

    内蒙古必威安泰生物科技有限公司 内蒙古呼和浩特 011500;

    内蒙古必威安泰生物科技有限公司 内蒙古呼和浩特 011500;

    内蒙古必威安泰生物科技有限公司 内蒙古呼和浩特 011500;

    内蒙古必威安泰生物科技有限公司 内蒙古呼和浩特 011500;

    内蒙古必威安泰生物科技有限公司 内蒙古呼和浩特 011500;

    内蒙古必威安泰生物科技有限公司 内蒙古呼和浩特 011500;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 家畜病毒学;
  • 关键词

    口蹄疫病毒; VP1基因; 密码子; 外源表达; 昆虫杆状病毒表达系统;

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