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基于生物信息学分析miR-143调控TLR2信号通路对溃疡性结肠炎的影响

         

摘要

目的基于生物信息学分析miR-143调控Toll样受体2(TLR2)信号通路对溃疡性结肠炎(UC)的影响。方法在GEO数据库中下载GSE75214、GSE53306、GSE48958基因数据集及miRNA数据集GSE68306进行分析。将符合标准的差异miRNA用miRDB软件预测靶基因并与筛选的差异基因映射,挑选出UC中关键miRNA进行实验。按随机数字表法将20只小鼠分为正常组及UC组,每组10只。用葡聚糖硫酸钠进行造模,苏木精-伊红染色法观察病理变化,ELISA检测肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量,Western blot检测结肠TLR2、白细胞介素-1β(IL-1β)蛋白含量,实时荧光定量PCR检测结肠组织miR-143、核转录因子-κB(NF-κB)、髓样分化因子(MyD88)含量。结果通过分析发现,共85个差异基因(包括34个下调及51个上调)及19个差异miRNA(5个DEMs高表达,14个DEMs低表达),其中miR-143为关键miRNA。实验显示,与正常组比较,UC组血清中TNF-α含量显著升高,结肠组织miR-143表达显著降低(P<0.05),TLR2、IL-1β蛋白表达明显升高,NF-κB、MyD88 mRNA含量升高(P<0.05)。结论miR-143为UC的重要miRNA,其可能通过调控TLR2通路影响UC发生发展。

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