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基于生物信息学及分子对接研究天牛止眩胶囊治疗原发性高血压的潜在活性成分及分子机制

         

摘要

目的利用生物信息学及分子对接,探讨天牛止眩胶囊治疗原发性高血压(essential hypertension,EH)的潜在活性成分及分子机制。方法利用中药系统药理学数据库和分析平台、BATMAN-TCM平台筛选天牛止眩胶囊的活性成分及药物靶点,使用GeneCards、PharmGkb、TTD、DrugBank检索EH的疾病相关靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“药物–成分–靶点”网络图,应用STRING平台进行蛋白质–蛋白质相互作用分析,使用R软件包进行基因本体论(gene ontology,GO)与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,运用AutoDockTools及AutoDock Vina进行分子对接验证,使用PyMol软件进行可视化分析。结果共筛选出天牛止眩胶囊有效成分53种,涉及相关靶点基因422个。筛选出关键活性化合物217个,拓扑分析得出核心靶点蛋白AKT1、MAPK8、NFKB1、FOS、MAPK1、JUN等10个,GO及KEGG富集分析结果提示天牛止眩胶囊干预EH主要涉及细胞对外的刺激、对活性氧的反应、氧化应激反应等多种生物学途径与涉及脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等相关通路。分子对接结果显示FOS与槲皮素及山柰酚结合力最强。结论天牛止眩胶囊中的槲皮素、山柰酚等多种关键活性成分可作用于FOS、JUN、AKT等多个核心靶点蛋白,发挥调控血压、降低心脑血管并发症危险等级、保护靶器官的作用。

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