结合最大团求精的随机投影模体发现算法

霍红卫; 于强; 牛伟

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结合最大团求精的随机投影模体发现算法

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模体发现是生物信息学和计算机科学中最具挑战性的问题之一，对未经比对的DNA序列中定位转录因子结合位点起着重要的作用。将模体发现问题转化为无向图中求解最大团的问题，并提出了一种结合最大团求精的随机投影模体发现算法（MCR2PA）。与原有的投影算法相比，对于大多数模体发现问题，MCR2PA的识别准确率都有所提高。多组真实生物数据上的实验结果验证了所提算法的实用性。特别地，对于酿酒酵母数据，预测准确率能够达到80％以上。

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来源
《中国科技论文》 |2013年第4期|P.342-349|共8页
作者
霍红卫; 于强; 牛伟;
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作者单位

西安电子科技大学计算机学院,西安710071;

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原文格式 PDF
正文语种 CHI
中图分类算法理论;
关键词
模体发现; 转录因子结合位点; 最大团; 随机投影;

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