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黄瓜RAV基因家族的全基因组分析

         

摘要

AP2/EREBP转录因子中的RAV基因家族在植物的发育过程中发挥着重要的调控作用。利用公布的黄瓜基因组数据库CuGI,发现黄瓜基因组中存在4个RAV基因,其蛋白序列均具有完整的AP2和B3结构域;对黄瓜、拟南芥、水稻和葡萄RAV蛋白进行多序列联配,结果表明该基因家族具有高度保守性;系统发生树结合基序分析发现,进化树亚族内各成员的基序组成相似;半定量RT-PCR结果显示,4个黄瓜RAV基因的表达广泛分布于各个组织。

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