参与番茄叶形发育的TCP转录因子的表达及生物信息分析

张雪莹; 尹一歌; 姜晶; 刘欣

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TCP是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育过程中起着重要作用.本试验选取18个在番茄叶片组织中高表达的TCP转录因子,检测其在叶片不同发育时期的表达水平,筛选出与叶片发育进程相关的SlTCP2、SlTCP4、SlTCP8、SlTCP11、SlTCP14、SlTCP15、SlTCP19、SlTCP22、SlTCP24、SlTCP25等10个TCP家族成员.对其进行生物信息分析,结果表明这10个SlTCP成员分布在8条不同的染色体上,它们的碱基、氨基酸长度以及分子量大小相差较大,均为不稳定的亲水性蛋白;SlTCPs的蛋白结构和成分分析表明,中间约50 aa长度的氨基酸序列保守性相对较高且丝氨酸占比较多;SlTCPs蛋白的亚细胞定位预测均在细胞核上.以上SlTCPs蛋白均含有TCP家族典型的保守域,其保守基序的分类与系统进化树的分支一致.组织表达分析结果表明,SlTCP11、SlTCP15、SlTCP24在番茄叶片发育各个时期的不同组织器官中,均有相对较高的表达水平.对番茄典型叶形突变体LA2922、LA2532及其对应的野生型进行qRT-PCR,结果表明SlTCP2、SlTCP11、SlTCP14、SlTCP15、SlTCP19、SlTCP24在LA2922和LA2532叶片中的表达水平呈相反趋势.结合生物信息分析结果,明确了SlTCP2、SlTCP11、SlTCP14、SlTCP15、SlTCP19、SlTCP24可能在番茄叶形发育中起关键作用,为进一步探究番茄叶片生长发育的分子机制奠定了基础.

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来源
《中国蔬菜》 |2021年第10期|45-56|共12页
作者
张雪莹; 尹一歌; 姜晶; 刘欣;
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作者单位

沈阳农业大学园艺学院设施园艺省部共建教育部重点实验室辽宁省设施园艺重点实验室辽宁沈阳110161;

沈阳农业大学园艺学院设施园艺省部共建教育部重点实验室辽宁省设施园艺重点实验室辽宁沈阳110161;

沈阳农业大学园艺学院设施园艺省部共建教育部重点实验室辽宁省设施园艺重点实验室辽宁沈阳110161;

沈阳农业大学园艺学院设施园艺省部共建教育部重点实验室辽宁省设施园艺重点实验室辽宁沈阳110161;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
番茄; TCP转录因子; 叶形发育; 生物信息学; 实时定量PCR;

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