人溶菌酶基因的密码子优化设计及生物信息学初步分析

沈冰蕾; 刘博洋; 杨润军; 任颖; 闫守庆; 白春艳; 张永宏

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人溶菌酶基因的密码子优化设计及生物信息学初步分析

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对猪乳蛋白密码子使用偏好性进行了分析,并基于其使用规则,在不改变编码氨基酸序列的基础上对人溶菌酶基因hLYZ的密码子进行了优化设计和生物信息学初步分析。研究结果表明,人hLYZ基因与猪乳蛋白相关基因的密码子使用频率存在明显差异,优化前后猪乳蛋白偏好性hLYZ基因(LYZ-Cas)共改变了109个碱基,约占hLYZ基因碱基总数的24.38%,G+C含量由47.0%下降至43.8%。改造前后hLYZ基因CDS序列所翻译的氨基酸序列比对结果显示,其氨基酸序列没有发生变化,二级结构预测及Nc值计算显示,其能够在猪乳中相对高效表达。本研究旨在分析并比较优化前后hLYZ基因密码子的生物信息学变化,使其在猪乳蛋白中高效表达,对于生产富含人溶菌酶的hLYZ转基因克隆猪具有重要的理论意义,并且对于提高仔猪成活率,防治哺乳动物乳腺炎,提高乳品质等方面具有巨大的应用潜力。

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来源
《中国兽医学报》 |2012年第9期|1392-1395|共5页
作者
沈冰蕾; 刘博洋; 杨润军; 任颖; 闫守庆; 白春艳; 张永宏;
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作者单位

黑龙江八一农垦大学动物科技学院;

黑龙江大庆163319;

吉林大学畜牧兽医学院;

吉林长春130062;

吉林大学农学部公共教学中心;

吉林长春130062;

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正文语种 chi
中图分类分子遗传学;
关键词
人溶菌酶基因; 密码子优化; 猪乳蛋白;

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