基于氨基酸代谢组学探讨HER2阳性乳腺癌曲妥珠单抗耐药生物标志物的价值分析

张文钧; 魏棒棒; 曹怿玮; 董春涛

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目的探讨人类表皮生长因子受体2(HER2)阳性乳腺癌曲妥珠单抗耐药细胞的氨基酸图谱,筛选诊断曲妥珠单抗耐药的潜在生物标志物。方法采用超高效液相色谱串联质谱(UHPLC-MS/MS)的靶向代谢组学方法检测HER2阳性乳腺癌曲妥珠单抗敏感细胞(BT474、SK-BR-3)和曲妥珠单抗耐药细胞(HCC1954、JIMT-1)的32种氨基酸水平。利用正交偏最小二乘判别分析观察各细胞的氨基酸表达差异,以P1.5或FC<0.67代表上调或下调为标准筛选差异氨基酸。通过支持向量机(SVM)诊断模型分析预测细胞的曲妥珠单抗耐药情况并采用受试者工作特征曲线(ROC)分析判断差异氨基酸的诊断价值。结果通过UHPLC-MS/MS技术共检测出32种氨基酸,根据筛选标准筛选出14种差异氨基酸,其中在曲妥珠单抗耐药细胞中犬尿氨酸、脯氨酸、苏氨酸和丙氨酸水平较曲妥珠单抗敏感组上升,而胱氨酸、精氨酸、天冬酰胺、甘氨酸、γ-氨基丁酸、半胱氨酸、N-乙酰-L-半胱氨酸、N-乙酰-L-天门冬氨酸、Nα-乙酰-L-赖氨酸和N-乙酰-L-谷氨酰胺共10种氨基酸水平较曲妥珠单抗敏感细胞下降,差异均有统计学意义(P<0.05)。联合14种差异氨基酸建立SVM耐药诊断模型,其ROC曲线下面积为1.000。结论在HER2阳性乳腺癌细胞中,氨基酸呈现不同程度的差异表达,联合犬尿氨酸、胱氨酸和脯氨酸等14种氨基酸分析在辅助诊断HER2阳性乳腺癌曲妥珠单抗耐药中可能具有一定潜在价值。

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来源
《临床肿瘤学杂志》 |2022年第12期|1111-1118|共8页
作者
张文钧; 魏棒棒; 曹怿玮; 董春涛;
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作者单位

南京鼓楼医院中心实验室;

江苏海洋大学药学院、江苏省海洋药物活性分子筛选重点实验室;

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正文语种 chi
中图分类乳腺肿瘤;
关键词
HER2阳性乳腺癌; 曲妥珠单抗耐药; 氨基酸; 靶向代谢组学; 生物标志物;

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