中波紫外线诱导的提前衰老成纤维细胞中环状RNA的表达及分析

司晨琛; 周炳荣; 骆丹

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中波紫外线诱导的提前衰老成纤维细胞中环状RNA的表达及分析

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目的:对于中波紫外线诱导的提前衰老的人类真皮成纤维细胞(UVB stress induced premature senescence,UVB-SIPS),笔者使用基因芯片筛选了其中环状RNA的表达谱.方法:构建UVB-SIPS模型;采用β-gal染色、细胞周期、CCK8(cell counting kit)检测衰老成纤维细胞;基因芯片技术筛选差异表达的环状RNA;聚合酶链式反应验证相关环状RNA;利用Clusterprofiler r package,对上下调基因分别进行KEGG和GO的富集分析.结果:与对照组比较(差异表达倍数≥1.5,P<0.05),共有472个差异表达的环状RNA,其中228个环状RNA上调,244个环状RNA下调.在472个差异表达的环状RNA中随机选择了8个环状RNA进行聚合酶链式反应.其中有5个环状RNA(hsa_circRNA_100797,hsa_circRNA_100686,hsa_circRNA_400036,hsa_circRNA_101755,hsa_circRNA_003794)与基因芯片的结果一致.GO分析显示,UVB-SIPS组细胞中差异表达的环状RNA亲本基因与细胞对紫外线辐射的反应、DNA修复复合物、有丝分裂、微管蛋白结合等注释条目有关;KEGG分析显示,UVB-SIPS组细胞与未处理组细胞相比,差异表达的环状RNA的亲本基因可能参与与衰老相关的细胞周期、p53信号通路、PPAR信号通路等的调节.结论:本研究初步揭示了提前衰老的人类真皮成纤维细胞中环状RNA的表达,可为未来研究光老化发生机制奠定基础.

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来源
《中国美容医学》 |2018年第12期|128-130162|共4页
作者
司晨琛; 周炳荣; 骆丹;
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作者单位

南京医科大学第一附属医院皮肤科江苏南京 210029;

南京医科大学第一附属医院皮肤科江苏南京 210029;

南京医科大学第一附属医院皮肤科江苏南京 210029;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类人体细胞学;
关键词
提前衰老成纤维细胞; 环状RNA; 基因芯片; 竞争结合; 生信分析; 中波紫外线;

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